RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000204268.2

Prrt3-203, Transcript of Proline-rich transmembrane protein 3, mouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Prrt3, Length 3,741 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Nup133	Q8R0G9	1155 aa		15.19	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Smc1b	Q920F6	1248 aa		15.19	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Gtpbp4	Q99ME9	634 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Cep89	Q9CZX2	791 aa		15.19	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Cfap45	Q9D9U9	551 aa		15.19	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Wtap	Q9ER69	396 aa		15.19	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Abca14	E9Q8F8	1683 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ubn2	Q80WC1	1314 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ano8	Q6PB70	1060 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Yeats4	Q9CR11	227 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Mei1	Q9D4I2	1268 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Donson	Q9QXP4	560 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Dhx8	A2A4P0	1244 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Plekhd1	B2RPU2	505 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Slc4a4	O88343	1079 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Zbtb40	Q6PCS8	1258 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Exoc8	Q6PGF7	716 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Lonrf3	Q9D4H7	753 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Gm43638	A0A0J9YU36	694 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Pramel3	A2AHA7	463 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Gm7903	A2AWL1	463 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	AV320801	A2AWL3	467 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Gm15023	L7MUB4	467 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Nlrp9a	Q66X03	949 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Rnf187	Q8BFX1	236 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Wasf1	Q8R5H6	559 aa		15.18	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Mypn	Q5DTJ9	1315 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Bin2	D3Z6Q9	489 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Gm42641	I6L9G2	585 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ncoa4	Q5U4H9	625 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Atrip	Q8BMG1	785 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Cenph	Q9QYM8	241 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Kdm6a	O70546	1401 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Qser1	A2BIE1	1698 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ccdc121	E9Q6D3	323 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Fez2	Q6TYB5	348 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Prl3d2	F6R3P9	224 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Stx8	O88983	236 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Kmt5b	Q3U8K7	883 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ehmt1	Q5DW34	1296 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ppm1m	Q8BU27	406 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ttc12	Q8BW49	704 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Phldb2	Q8K1N2	1249 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Riok1	Q922Q2	567 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Znf704	Q9ERQ3	566 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Pde3a	Q9Z0X4	1141 aa		15.17	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ampd3	O08739	766 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ftl2	P49945	183 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ift88	Q61371	824 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Nlrp9b	Q66X22	1003 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Panx2	Q6IMP4	677 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Rad17	Q6NXW6	688 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ctif	Q6PEE2	600 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Txndc16	Q7TN22	820 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Cyp4f39	Q8BGU0	532 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Rtn1	Q8K0T0	780 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Krt23	Q99PS0	422 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Nap1l1	P28656	391 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Specc1l	Q2KN98	1118 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Arglu1	Q3UL36	271 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Tcp11l1	Q8BTG3	509 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Kiaa1524	Q8BWY9	907 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Emilin1	Q99K41	1017 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Cwc15	Q9JHS9	229 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ugt1a6b	K9J7B2	531 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ugt1a6	Q64435	531 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Rragb	Q6NTA4	374 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ugt1a7c	Q6ZQM8	531 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Trim34a	Q99PP6	485 aa		15.16	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Nktr	P30415	1453 aa		15.15	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Rgs9	O54828	675 aa		15.15	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ggt6	Q6PDE7	497 aa		15.15	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ppp2r2c	Q8BG02	447 aa		15.15	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Smarcc2	Q6PDG5	1213 aa		15.15	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Zc3h6	Q8BYK8	1177 aa		15.15	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ccdc73	Q8CDM4	1066 aa		15.15	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Kri1	Q8VDQ9	704 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Dnajc14	Q921R4	703 aa		15.15	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Lmbr1	Q9JIT0	490 aa		15.15	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Chm	Q9QXG2	665 aa		15.15	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	C87499	Q3UX49	493 aa		15.15	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Asap2	Q7SIG6	958 aa		15.15	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Cfap69	Q8BH53	942 aa		15.15	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ppfibp1	Q8C8U0	969 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Odf2	A3KGV1	830 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Rsph10b	E9PYQ0	876 aa		15.14	■□□□□ 0.01
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Cyp2d10	P24456	504 aa		15.14	■□□□□ 0.01
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Anks1a	P59672	1150 aa		15.14	■□□□□ 0.01
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ccdc57	Q6PHN1	1016 aa		15.14	■□□□□ 0.01
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Bola3	Q8CEI1	110 aa		15.14	■□□□□ 0.01
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Amfr	Q9R049	643 aa		15.14	■□□□□ 0.01
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Arhgef28	P97433	1693 aa		15.14	■□□□□ 0.01
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Cops6	O88545	324 aa		15.14	■□□□□ 0.01
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ms4a1	P19437	291 aa		15.14	■□□□□ 0.01
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Abtb2	Q7TQI7	1024 aa		15.14	■□□□□ 0.01
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Pdia6	Q922R8	440 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Ranbp1	P34022	203 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Mycbpap	Q5SUV2	932 aa		15.14	■□□□□ 0.01
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Map3k11	Q80XI6	850 aa		15.14	■□□□□ 0.01
Prrt3-203	ENSMUST00000204268	Nek9	Q8K1R7	984 aa		15.14	■□□□□ 0.01

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.2 ms