RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 C9orf16Q9BUW7 83 aa11.87□□□□□ -0.51
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SH3BP2-215ENST00000510074 IDO2Q6ZQW0 420 aa11.84□□□□□ -0.51
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SH3BP2-215ENST00000510074 OR4A4PQ8NGN8 299 aa11.81□□□□□ -0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
SH3BP2-215ENST00000510074 TRAV25A0A0B4J276 109 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM213A2RRL7 107 aa11.8□□□□□ -0.52
SH3BP2-215ENST00000510074 EFCAB10A6NFE3 127 aa11.8□□□□□ -0.52
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SH3BP2-215ENST00000510074 BTNL8Q6UX41 500 aa11.8□□□□□ -0.52
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