RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa0.53□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BAP18Q8IXM2 172 aa0.53□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TLCD1Q96CP7 247 aa0.53□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRAPPC13A5PLN9 417 aa0.52□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HCRTO43612 131 aa0.52□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H2BFSP57053 126 aa0.52□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MIAQ16674 131 aa0.52□□□□□ -2.33
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EMC3Q9P0I2 261 aa0.52□□□□□ -2.33
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP5G1P05496 136 aa0.5□□□□□ -2.33
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C9orf163Q8N9P6 203 aa0.5□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR52E4Q8NGH9 312 aa0.5□□□□□ -2.33
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLEC12BQ2HXU8 276 aa0.48□□□□□ -2.33
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STOML3Q8TAV4 291 aa0.48□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIKE1Q9BRV8 207 aa0.48□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GREB1Q4ZG55 1949 aa0.47□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C9JCJ5 164 aa0.47□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MT-CO2P00403 227 aa0.47□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FXYD7P58549 80 aa0.47□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPHB5Q86YW7 130 aa0.47□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BLIDQ8IZY5 108 aa0.47□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LFNGQ8NES3 379 aa0.47□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPCDCQ96CD2 204 aa0.47□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GLI3P10071 1580 aa0.47□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FLT4P35916 1363 aa0.46□□□□□ -2.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa0.46□□□□□ -2.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 METTL15A6NJ78 407 aa0.46□□□□□ -2.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ORC5O43913 435 aa0.46□□□□□ -2.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SYT1P21579 422 aa0.46□□□□□ -2.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MIPP30301 263 aa0.46□□□□□ -2.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPL28P46779 137 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ETV1P50549 477 aa0.46□□□□□ -2.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAS2R20P59543 309 aa0.46□□□□□ -2.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HPCAP84074 193 aa0.46□□□□□ -2.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GNA13Q14344 377 aa0.46□□□□□ -2.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C4orf26Q17RF5 130 aa0.46□□□□□ -2.34
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q3ZCU0 254 aa0.46□□□□□ -2.34
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