RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 hADV38S2A0JD32 116 aa13.8□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 ITGB1BP1O14713 200 aa13.8□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 MMP23AO75900 390 aa13.8□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 GNG10P50151 68 aa13.8□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 SPINK9Q5DT21 86 aa13.8□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa13.8□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 OR8G2PQ6IF36 304 aa13.8□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP13.8□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 DTD1Q8TEA8 209 aa13.8□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 CORO2AQ92828 525 aa13.8□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 TSPAN4O14817 238 aa13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 ZG16O60844 167 aa13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 F12P00748 615 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 GUK1Q16774 197 aa13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 LYG1Q8N1E2 194 aa13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 MS4A5Q9H3V2 200 aa13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 NCOR2Q9Y618 2525 aa13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 PLAUP00749 431 aa13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 OR9G9P0C7N8 305 aa13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 C1QTNF9P0C862 333 aa13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 OR2B8PP59922 312 aa13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 RSG1Q9BU20 258 aa13.79□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 CEBPZOSA8MTT3 80 aa13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 GPR37O15354 613 aa13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 SLC38A11Q08AI6 406 aa13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 OR4C12Q96R67 309 aa13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 LINC00574Q9H8X3 128 aa13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 LINC00312Q9Y6C7 94 aa13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 PPT1P50897 306 aa13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 RPL31P62899 125 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 ZNF273Q14593 569 aa13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 ZNF439Q8NDP4 499 aa13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 GAB2Q9UQC2 676 aa13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 FAM157AC9JC47 383 aa13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 ERVFRD-1P60508 538 aa13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 ERVK-16P61578 105 aa13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 DOCK11Q5JSL3 2073 aa13.77□□□□□ -0.2
TOM1-216ENST00000492723 H2AFB1P0C5Y9 115 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 KIR2DS2P43631 304 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 PEA15Q15121 130 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 LYPD2Q6UXB3 125 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 DDB2Q92466 427 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 SCRT1Q9BWW7 348 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 FAM74A7A6NL05 159 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 B9A039 149 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 FCN3O75636 299 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 IFNA17P01571 189 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 NQO2P16083 231 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 ADORA2A-AS1P86434 159 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 EFNB3Q15768 340 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 FAM74A3Q4VXF1 159 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 LFNGQ8NES3 379 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 OR4A16Q8NH70 328 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 OR4S2Q8NH73 311 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 ZNF251Q9BRH9 671 aa13.77□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa13.76□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 RPS16P62249 146 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 CCL20P78556 96 aa13.76□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 CDSNQ15517 529 aa13.76□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 PBDC1Q9BVG4 233 aa13.76□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa13.76□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 NDUFB3O43676 98 aa13.76□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 SNAPINO95295 136 aa13.76□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 CCL3L1P16619 93 aa13.76□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 THBS3P49746 956 aa13.76□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 TMEM30BQ3MIR4 351 aa13.76□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 ZNRD1Q9P1U0 126 aa13.76□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 HCFC1P51610 2035 aa13.75□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa13.75□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa13.75□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 PPIHO43447 177 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 TLE4Q04727 773 aa13.75□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 TMEM200BQ69YZ2 307 aa13.75□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 SPSB3Q6PJ21 355 aa13.75□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa13.75□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 SFT2D1Q8WV19 159 aa13.75□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 TMEM140Q9NV12 185 aa13.75□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa13.75□□□□□ -0.21
TOM1-216ENST00000492723 SIAH2O43255 324 aa13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms