RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489053.1

HDAC6-232, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC6, Length 539 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-232ENST00000489053 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 BEST4Q8NFU0 473 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 MS4A10Q96PG2 267 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 KLK15Q9H2R5 256 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 GAB2Q9UQC2 676 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 A0A0G2JLM5 398 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 DPPA5A6NC42 116 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 LINC01619G3V211 115 aa7.12□□□□□ -1.27
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HDAC6-232ENST00000489053 RAMP3O60896 148 aa7.12□□□□□ -1.27
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HDAC6-232ENST00000489053 IGLV1-40P01703 118 aa7.12□□□□□ -1.27
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HDAC6-232ENST00000489053 LINC00205P59089 165 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 HERV-K104P61576 105 aa7.12□□□□□ -1.27
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HDAC6-232ENST00000489053 UBE2NLQ5JXB2 153 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 POC5Q8NA72 575 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 MINDY2Q8NBR6 621 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 OR5H6Q8NGV6 325 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 OR4S2Q8NH73 311 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 CASTOR1Q8WTX7 329 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 BORCS5Q969J3 196 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 TMEM68Q96MH6 324 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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HDAC6-232ENST00000489053 COA4Q9NYJ1 87 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 SPATA2Q9UM82 520 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 PLXNB1O43157 2135 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 SAP30O75446 220 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 IGHV3-11P01762 117 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 FCER2P06734 321 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 FCGR2CP31995 323 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 ECI1P42126 302 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 KIR2DS2P43631 304 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 FXYD4P59646 89 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 UBE2KP61086 200 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 CD69Q07108 199 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 CATR1Q13166 79 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 TMEM177Q53S58 311 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 TEX45Q8NA69 505 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 OR5T1Q8NG75 326 aa7.11□□□□□ -1.27
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HDAC6-232ENST00000489053 AIFM2Q9BRQ8 373 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 AUNIPQ9H7T9 357 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 TAS2R8Q9NYW2 309 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 MEIS3P1A6NDR6 274 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 H3BUA1 57 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 OVOL1O14753 267 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 XRCC3O43542 346 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 SSX5O60225 188 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 PROP1O75360 226 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 HRASP01112 189 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 HLA-DQB1P01920 261 aa7.1□□□□□ -1.27
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HDAC6-232ENST00000489053 S100GP29377 79 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 INSL3P51460 131 aa7.1□□□□□ -1.27
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HDAC6-232ENST00000489053 MMD2Q8IY49 270 aa7.1□□□□□ -1.27
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HDAC6-232ENST00000489053 OR13F1Q8NGS4 319 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.1□□□□□ -1.27
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HDAC6-232ENST00000489053 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 OR4C12Q96R67 309 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 EHFQ9NZC4 300 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 MSGN1A6NI15 193 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 LINC00473A8K010 186 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 I3L521 148 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC6-232ENST00000489053 K7EIL1 84 aa7.09□□□□□ -1.27
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