RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa2.07□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP2.07□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 MYH7P12883 1935 aa2.07□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 MEIKINA0A087WXM9 373 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC5A10A0PJK1 596 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 C9orf170A2RU37 121 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 MGAT4DA6NG13 374 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 GGT3PA6NGU5 568 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 OR5H1A6NKK0 313 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 PPP5D1E7EU14 171 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 F6UZH7 168 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 H3BN98 237 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 SMLR1H3BR10 107 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 GOSR2O14653 212 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 TP53I11O14683 189 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 HSD17B6O14756 317 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF208O43345 1280 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC37A4O43826 429 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 STK16O75716 305 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 OR2J2O76002 312 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 SCGNO76038 276 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 PROSCO94903 275 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 DIRAS1O95057 198 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 SCELO95171 688 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 VAMP5O95183 116 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 RCBTB2O95199 551 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 FARS2O95363 451 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 CLIC3O95833 236 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 CRHP06850 196 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 OR5AC1P0C628 307 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 TPT1P13693 172 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 GTF2F2P13984 249 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 RAB5AP20339 215 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 GADD45AP24522 165 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 OR1E1P30953 314 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 MAP2K4P45985 399 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 IDH2P48735 452 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 TTPAP49638 278 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 AKR1C2P52895 323 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 UBE2G2P60604 165 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 RAB11AP62491 216 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 ACTG2P63267 376 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 H3F3AP84243 136 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 CDK5Q00535 292 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 EMX2Q04743 252 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 ACVR1Q04771 509 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 VAMP3Q15836 100 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 DEFB133Q30KQ1 61 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 TTLL9Q3SXZ7 439 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 SPIN4Q56A73 249 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 Q5BKY6 102 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM74A1Q5RGS3 127 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 SAMD13Q5VXD3 122 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 Q5W150 140 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 CARD17Q5XLA6 110 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 SAXO2Q658L1 398 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 XAF1Q6GPH4 301 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 CNIH2Q6PI25 160 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 ALKAL2Q6UX46 152 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 CASP12Q6UXS9 341 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 NPSR1Q6W5P4 371 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 NDUFAF7Q7L592 441 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 GRINAQ7Z429 371 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC30A8Q8IWU4 369 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 BAP18Q8IXM2 172 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM123Q8N131 208 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 GABRG1Q8N1C3 465 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 JAGN1Q8N5M9 183 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 PQLC3Q8N755 202 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM104Q8NE00 496 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF738Q8NE65 137 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 PLPP5Q8NEB5 264 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 OR4F6Q8NGB9 312 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 OR4D6Q8NGJ1 314 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 UBA3Q8TBC4 463 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 LCN9Q8WX39 176 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 HGDQ93099 445 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 TMBIM1Q969X1 311 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 RMI2Q96E14 147 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 BTF3L4Q96K17 158 aa2.06□□□□□ -2.08
RABGGTB-206ENST00000467748 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.6 ms