RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 GSTT2P0CG29 244 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 GSTT2BP0CG30 244 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 C8orf88P0DMB2 117 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 APELAP0DMC3 54 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 CTRB1P17538 263 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 EDN2P20800 178 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 GALP22466 123 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 ADMP35318 185 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 ARL3P36405 182 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 UBE2KP61086 200 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 TNXAQ16473 311 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 PRSS8Q16651 343 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 RTL8BQ17RB0 113 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 Q499Y3 187 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 DNAL1Q4LDG9 190 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 CTRB2Q6GPI1 263 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 CACNG8Q8WXS5 425 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 FAAP24Q9BTP7 215 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 C5orf66Q9H5L9 145 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 ORC6Q9Y5N6 252 aa11.07□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa11.06□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 M0R1X1 148 aa11.06□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 PRH1P02810 166 aa11.06□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 UBBP0CG47 229 aa11.06□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 MYOD1P15172 320 aa11.06□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 MFAP2P55001 183 aa11.06□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 ELLP55199 621 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 LINC00205P59089 165 aa11.06□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 YIF1BQ5BJH7 314 aa11.06□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 BTNL8Q6UX41 500 aa11.06□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa11.06□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 SMIM19Q96E16 107 aa11.06□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa11.06□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 DNAH6Q9C0G6 4158 aa11.05□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 TSPAN4O14817 238 aa11.05□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 GYG2O15488 501 aa11.05□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 OGG1O15527 345 aa11.05□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 OR2J3O76001 311 aa11.05□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa11.05□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa11.05□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 NKAIN3Q8N8D7 197 aa11.05□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 SETD6Q8TBK2 473 aa11.05□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 CSTL1Q9H114 145 aa11.05□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 AP4S1Q9Y587 144 aa11.05□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 MPTX1A8MV57 137 aa11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 DHFRP00374 187 aa11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 PSMB6P28072 239 aa11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 SERPINB10P48595 397 aa11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 C6orf201Q7Z4U5 140 aa11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 AMIGO2Q86SJ2 522 aa11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 SETD9Q8NE22 299 aa11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 ORAI1Q96D31 301 aa11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 HRH4Q9H3N8 390 aa11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 BABAM2Q9NXR7 383 aa11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 OR1A1Q9P1Q5 309 aa11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 UFC1Q9Y3C8 167 aa11.04□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 FAT2Q9NYQ8 4349 aa11.03□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 LIMS3P0CW19 117 aa11.03□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 LIMS4P0CW20 117 aa11.03□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 ZNF585BQ52M93 769 aa11.03□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 CLEC19AQ6UXS0 136 aa11.03□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 MMD2Q8IY49 270 aa11.03□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 OR52I1Q8NGK6 324 aa11.03□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 ADTRPQ96IZ2 230 aa11.03□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 SLC29A1Q99808 456 aa11.03□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa11.03□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 OAZ3Q9UMX2 235 aa11.03□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 DNAH11Q96DT5 4516 aa11.02□□□□□ -0.64
NELFE-204ENST00000436289 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa11.02□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 OR4C46A6NHA9 309 aa11.02□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 NPIPB5A8MRT5 1133 aa11.02□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 GABRB1P18505 474 aa11.02□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 HLA-DRB3P79483 266 aa11.02□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 XAF1Q6GPH4 301 aa11.02□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 CENPSQ8N2Z9 138 aa11.02□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 OR11H2Q8NH07 326 aa11.02□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 RDH8Q9NYR8 311 aa11.02□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 UBQLN2Q9UHD9 624 aa11.02□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 SELENOKQ9Y6D0 94 aa11.02□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 DNAH2Q9P225 4427 aa11.02□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa11.01□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 DPPA5A6NC42 116 aa11.01□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 RTL8CO15255 209 aa11.01□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 DCKP27707 260 aa11.01□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 GNGT1P63211 74 aa11.01□□□□□ -0.65
NELFE-204ENST00000436289 MED21Q13503 144 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms