RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS1-202ENST00000323081 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS1-202ENST00000323081 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.65□□□□□ -0.06
SPNS1-202ENST00000323081 ACACAQ13085 2346 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 MARCH11A6NNE9 402 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 B4DEV8 164 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 ELLP55199 621 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 EDDM3BP56851 147 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 MORN2Q502X0 79 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 NCR3LG1Q68D85 454 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 Q8WTZ3 238 aa14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 FAM27E3Q08E93 113 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 HNF4GQ14541 408 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 TMEM41BQ5BJD5 291 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 SPINK9Q5DT21 86 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 SSX7Q7RTT5 188 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 MBD3L1Q8WWY6 194 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 JPT1Q9UK76 154 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 ZFP92A6NM28 416 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 PROP1O75360 226 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 LHBP01229 141 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 IGHV3-7P01780 117 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 FAM201AQ5SY85 155 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF665Q9H7R5 613 aa14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 CEBPZOSA8MTT3 80 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 A8MXE2 369 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 CXCL1P09341 107 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 BMP5P22003 454 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 S100A2P29034 98 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 FAM209BQ5JX69 171 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 R3HDM4Q96D70 268 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 PLCE1Q9P212 2302 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 YPEL1O60688 119 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 FCGR3BO75015 233 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 YIF1AO95070 293 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 IGHV2-70P01814 119 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 NDUFA6P56556 154 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 ATP6V1FQ16864 119 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 CR1LQ2VPA4 569 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 OR10P1Q8NGE3 313 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 OR13D1Q8NGV5 346 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 YPEL2Q96QA6 119 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 GGACTQ9BVM4 153 aa14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa14.61□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 BCL2P10415 239 aa14.61□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 LOXL3P58215 753 aa14.61□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 TMEM147Q9BVK8 224 aa14.61□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.61□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.61□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa14.61□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 ICE1Q9Y2F5 2266 aa14.61□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.61□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 PMS2P5A8MQ11 134 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 M0R1X1 148 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 CCKARP32238 428 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 TDGF1P3P51864 188 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF134P52741 427 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 SELENOVP59797 346 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 ERVFRD-1P60508 538 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 DOK5Q9P104 306 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 TIMM9Q9Y5J7 89 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 F2RL2O00254 374 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 SELLP14151 372 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 RAB11AP62491 216 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 CALYQ9NYX4 217 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 OR6C3Q9NZP0 311 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.6□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 CYB5BO43169 146 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 HPRT1P00492 218 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 OR9G9P0C7N8 305 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 GATA4P43694 442 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 SSX9Q7RTT3 188 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 DOLPP1Q86YN1 238 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 C1orf87Q8N0U7 546 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa14.59□□□□□ -0.07
SPNS1-202ENST00000323081 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.7 ms