RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1-208ENST00000586667 RLN1P04808 185 aa10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 VSIG10L2P0DP72 767 aa10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 PGAM2P15259 253 aa10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 CD24P25063 80 aa10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 ECI1P42126 302 aa10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 IER3P46695 156 aa10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 RAB13P51153 203 aa10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 C16orf87Q6PH81 154 aa10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 KCTD9Q7L273 389 aa10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 NRARPQ7Z6K4 114 aa10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 ZDHHC22Q8N966 263 aa10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 ZBTB34Q8NCN2 500 aa10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 OCEL1Q9H607 264 aa10.09□□□□□ -0.79
DNMT1-208ENST00000586667 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 CENPXA8MT69 81 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 H3BUX3 64 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 CHST1O43916 411 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 RAMP3O60896 148 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 SPNP16150 400 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 THBS3P49746 956 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 PIGPP57054 158 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 EBI3Q14213 229 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF66Q6ZN08 573 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 MOB3BQ86TA1 216 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 TBC1D26Q86UD7 250 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 RITA1Q96K30 269 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 SSX3Q99909 188 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 C20orf85Q9H1P6 137 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 FLVCR2Q9UPI3 526 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 TCF19Q9Y242 345 aa10.08□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 A6NDX4 124 aa10.07□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 IGKV1D-33P01593 117 aa10.07□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 IGKV1-33P01594 117 aa10.07□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 CD1BP29016 333 aa10.07□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 HILS1P60008 231 aa10.07□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 OR2B11Q5JQS5 317 aa10.07□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 LPCAT3Q6P1A2 487 aa10.07□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 POC5Q8NA72 575 aa10.07□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 OR51H1Q8NH63 302 aa10.07□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa10.07□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 SSMEM1Q8WWF3 244 aa10.07□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 ADTRPQ96IZ2 230 aa10.07□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 NUDT15Q9NV35 164 aa10.07□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 WASHC3Q9Y3C0 194 aa10.07□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 H0Y980 276 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 CLDN34H7C241 214 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 MPPED1O15442 326 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 TCRBP04435 133 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 F2RP25116 425 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 MECP2P51608 486 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 SCGB2A2Q13296 93 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 SLC9A3R2Q15599 337 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 ZNF585BQ52M93 769 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 THNSL2Q86YJ6 484 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 PDPNQ86YL7 162 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 CMTM1Q8IZ96 169 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 TMEM86BQ8N661 226 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 DUSP18Q8NEJ0 188 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 ZFAND1Q8TCF1 268 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 CAPSLQ8WWF8 208 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 TP53RKQ96S44 253 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 CHIAQ9BZP6 476 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 DPAGT1Q9H3H5 408 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 NAA60Q9H7X0 242 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 PLSCR3Q9NRY6 295 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 SLC35D1Q9NTN3 355 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 VPREB3Q9UKI3 123 aa10.06□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 PTTG1O95997 202 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 IGKV1-39P01597 117 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 IGLV2-23P01705 113 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 IGKV1D-39P04432 117 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 CNTFRP26992 372 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 BRS3P32247 399 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 DEFA1P59665 94 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 DEFA3P59666 94 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 DHODHQ02127 395 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 ABCA11PQ4W5N1 156 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 TMEM177Q53S58 311 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 MZT2BQ6NZ67 158 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 TMED4Q7Z7H5 227 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 SLC25A42Q86VD7 318 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 TMEM219Q86XT9 240 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 OR5R1Q8NH85 324 aa10.05□□□□□ -0.8
DNMT1-208ENST00000586667 ZDHHC16Q969W1 377 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms