RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580081.1

CLTC-212, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 4

Gene CLTC, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-212ENST00000580081 SIRPDQ9H106 197 aa7.15□□□□□ -1.26
CLTC-212ENST00000580081 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa7.15□□□□□ -1.26
CLTC-212ENST00000580081 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.15□□□□□ -1.26
CLTC-212ENST00000580081 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.15□□□□□ -1.26
CLTC-212ENST00000580081 POLQO75417 2590 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 TXNL1O43396 289 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 PROP1O75360 226 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 ATG12O94817 140 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 TOX4O94842 621 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 OR2A4O95047 310 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 MMP9P14780 707 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 GATA3P23771 443 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 COX7A1P24310 79 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 RAP2BP61225 183 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 C2orf68Q2NKX9 166 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 TMEM268Q5VZI3 342 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 ZNF695Q8IW36 515 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 PNKDQ8N490 385 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 C18orf12Q96KH6 178 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 OR2A7Q96R45 310 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 FOXC2Q99958 501 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 MMP26Q9NRE1 261 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 PRR13Q9NZ81 148 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 TMED3Q9Y3Q3 217 aa7.14□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 C5orf51A6NDU8 294 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 LINC00473A8K010 186 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 A8MV72 311 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 ODF3BA8MYP8 253 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 CCSO14618 274 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 ADAP1O75689 374 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 APOA2P02652 100 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 HOXB5P09067 269 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 RRASP10301 218 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 VDAC1P21796 283 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 CEACAM3P40198 252 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 H2BFSP57053 126 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 CYCSP99999 105 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 PAX8Q06710 450 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 ZNF585BQ52M93 769 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 DCAF12L2Q5VW00 463 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 HCP5Q6MZN7 132 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 SLC35G3Q8N808 338 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 OR4S2Q8NH73 311 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 DDB2Q92466 427 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 Q96MF0 132 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 TBX15Q96SF7 602 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 SPIN2AQ99865 258 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 PCGF1Q9BSM1 259 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 REG4Q9BYZ8 158 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 CHIAQ9BZP6 476 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 COMMD9Q9P000 198 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.13□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 FAM25EA8MYX2 175 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 LEUTXA8MZ59 168 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 FCGR3BO75015 233 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 SIX6O95475 246 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 ARG1P05089 322 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 CT45A6P0DMU7 189 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 CT45A5P0DMU8 189 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 CT45A7P0DMV0 189 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 HTR1DP28221 377 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 LPAR6P43657 344 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 GZMKP49863 264 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 RAB13P51153 203 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 UBE2E1P51965 193 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 DLX1P56177 255 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 KLRD1Q13241 179 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 RTL8BQ17RB0 113 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 FAM219AQ8IW50 185 aa7.12□□□□□ -1.27
CLTC-212ENST00000580081 ZNF383Q8NA42 475 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms