RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGKV1-16P04430 117 aa18.12■□□□□ 0.49
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNB1P62873 340 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF260Q3ZCT1 412 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C19orf54Q5BKX5 351 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UBE2UQ5VVX9 321 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa18.12■□□□□ 0.49
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOLLIPQ9H0E2 274 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR2D2Q9H210 308 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC35D1Q9NTN3 355 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD40LGP29965 261 aa18.1■□□□□ 0.49
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 NR2C2APQ86WQ0 139 aa18.1■□□□□ 0.49
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 PYHIN1Q6K0P9 492 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FCGR1BQ92637 280 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MS4A10Q96PG2 267 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRR25Q96S07 402 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 B9D2Q9BPU9 175 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SDHAF2Q9NX18 166 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STUB1Q9UNE7 303 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL7A1Q02388 2944 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NOTOA8MTQ0 251 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DIRAS3O95661 229 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CBX3Q13185 183 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FXYD3Q14802 87 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARL6IP1Q15041 203 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C11orf87Q6NUJ2 197 aa18.08■□□□□ 0.48
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SSR3Q9UNL2 185 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OVOL1O14753 267 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNIH1O95406 144 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LGALS7P47929 136 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDNFQ49AH0 187 aa18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINC01619G3V211 115 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHV3-11P01762 117 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 INSL3P51460 131 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TPPP2P59282 170 aa18.06■□□□□ 0.48
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 TPRA1Q86W33 373 aa18.06■□□□□ 0.48
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DAPK2Q9UIK4 370 aa18.06■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLURP1P55000 103 aa18.05■□□□□ 0.48
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 HARBI1Q96MB7 349 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa18.05■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa18.04■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SHOXO15266 292 aa18.04■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LY86O95711 162 aa18.04■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGLV2-23P01705 113 aa18.04■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRGV3P03979 118 aa18.04■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DTYMKP23919 212 aa18.04■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C5orf30Q96GV9 206 aa18.04■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLA2Q9H6Q3 261 aa18.04■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A087WW49 117 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 J3QRK9 145 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RRASP10301 218 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PJVKQ0ZLH3 352 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HACD4Q5VWC8 232 aa18.03■□□□□ 0.48
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF773Q6PK81 442 aa18.03■□□□□ 0.48
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