RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa14.57□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 CRISP2P16562 243 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 ERVS71-1P61550 626 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 GPR146Q96CH1 333 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 DNAJC13O75165 2243 aa14.56□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 CCDC88CQ9P219 2028 aa14.56□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.56□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 FAM27E3Q08E93 113 aa14.56□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 METTL26Q96S19 204 aa14.56□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 AP4M1O00189 453 aa14.55□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 TMEM183BQ1AE95 376 aa14.54□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 CD59P13987 128 aa14.54□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 ZNF253O75346 499 aa14.53□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 KBTBD11O94819 623 aa14.53□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 CLDN18P56856 261 aa14.53□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 SRD5A3Q9H8P0 318 aa14.53□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.086e-7■■■□□ 16
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NISCH-213ENST00000489895 TCL1AP56279 114 aa14.52□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 HCP5Q6MZN7 132 aa14.52□□□□□ -0.08
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NISCH-213ENST00000489895 RD3LP0DJH9 198 aa14.52□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 HKR1P10072 659 aa14.52□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 IGHV1-2P23083 117 aa14.52□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.52□□□□□ -0.08
NISCH-213ENST00000489895 ABCA7Q8IZY2 2146 aa14.52□□□□□ -0.09
NISCH-213ENST00000489895 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa14.52□□□□□ -0.09
NISCH-213ENST00000489895 TCAPO15273 167 aa14.52□□□□□ -0.09
NISCH-213ENST00000489895 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NISCH-213ENST00000489895 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
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