RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 HOGA1Q86XE5 327 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 DDB2Q92466 427 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 OR4F4Q96R69 305 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 OR51J1Q9H342 316 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 DIABLOQ9NR28 239 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 SOX15O60248 233 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 TUSC2O75896 110 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 CRYGBP07316 175 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 PF4V1P10720 104 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 TAS2R20P59543 309 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 SLC35B1P78383 322 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 CX3CL1P78423 397 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 TEX38Q6PEX7 206 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 PDPNQ86YL7 162 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 RNF152Q8N8N0 203 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 BVESQ8NE79 360 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.4□□□□□ -1.06
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ATG4B-210ENST00000428861 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 DUX3Q96PT4 197 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 CLCC1Q96S66 551 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 GPHA2Q96T91 129 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 KLK15Q9H2R5 256 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 PARP11Q9NR21 331 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 KIAA1456Q9P272 454 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 COMMD3Q9UBI1 195 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF580Q9UK33 172 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A17O43808 307 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 HPGDSO60760 199 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 RBBP9O75884 186 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 CA2P00918 260 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 IGHG4P01861 327 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 CTXN2P0C2S0 81 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 ELK1P19419 428 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 VDAC1P21796 283 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 AADACP22760 399 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 PSMB8P28062 276 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.39□□□□□ -1.07
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ATG4B-210ENST00000428861 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.39□□□□□ -1.07
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ATG4B-210ENST00000428861 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 RNF5Q99942 180 aa8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
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ATG4B-210ENST00000428861 IGLV1-40P01703 118 aa8.38□□□□□ -1.07
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ATG4B-210ENST00000428861 IGLL1P15814 213 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 FCGR2CP31995 323 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 THBS3P49746 956 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
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ATG4B-210ENST00000428861 PLGLAQ15195 96 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 ECSCRQ19T08 205 aa8.38□□□□□ -1.07
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ATG4B-210ENST00000428861 TMEM177Q53S58 311 aa8.38□□□□□ -1.07
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ATG4B-210ENST00000428861 LINC00482Q8N8I6 264 aa8.38□□□□□ -1.07
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ATG4B-210ENST00000428861 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.38□□□□□ -1.07
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ATG4B-210ENST00000428861 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 A3GALT2U3KPV4 340 aa8.38□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 SPDEFO95238 335 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 PF4P02776 101 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 OR5H8P0DN80 308 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 RORCP51449 518 aa8.37□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ATG4B-210ENST00000428861 ARPC4P59998 168 aa8.37□□□□□ -1.07
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