RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 TXNL1O43396 289 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 SNAPC5O75971 98 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 OR2A4O95047 310 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 GATA3P23771 443 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF137PP52743 207 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 CD83Q01151 205 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 LEAP2Q969E1 77 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 OR2A7Q96R45 310 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 SPIN2AQ99865 258 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 AIFM2Q9BRQ8 373 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 PDCD10Q9BUL8 212 aa14.72□□□□□ -0.05
SYNE4-201ENST00000324444 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 RRASP10301 218 aa14.71□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 CEACAM3P40198 252 aa14.71□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 PAX2Q02962 417 aa14.71□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 FGL1Q08830 312 aa14.71□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 SP6Q3SY56 376 aa14.71□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.71□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 OR11H6Q8NGC7 330 aa14.71□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 C1orf159Q96HA4 380 aa14.71□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 C5orf51A6NDU8 294 aa14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 SLC31A2O15432 143 aa14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 CD5LO43866 347 aa14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 IGHV3-7P01780 117 aa14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 CXCL3P19876 107 aa14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 VDAC1P21796 283 aa14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 HLA-DRB5Q30154 266 aa14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 Q8N7P7 452 aa14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 ZFP57Q9NU63 452 aa14.7□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.69□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 CRLF1O75462 422 aa14.69□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 TOX4O94842 621 aa14.69□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 IGLV1-47P01700 117 aa14.69□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 EPHA1P21709 976 aa14.69□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 FAM219AQ8IW50 185 aa14.69□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 ODF3L1Q8IXM7 274 aa14.69□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.69□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 NMES1Q9C002 83 aa14.69□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.69□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 COMMD9Q9P000 198 aa14.69□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 INSIG2Q9Y5U4 225 aa14.69□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 A0A1W2PPE3 182 aa14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 FAM25EA8MYX2 175 aa14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 APOA2P02652 100 aa14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 MSMBP08118 114 aa14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 HOXB5P09067 269 aa14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 MC5RP33032 325 aa14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 RTL8BQ17RB0 113 aa14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 OR4S2Q8NH73 311 aa14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 C2orf50Q96LR7 162 aa14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF251Q9BRH9 671 aa14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 SIRPDQ9H106 197 aa14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 PLEKHA2Q9HB19 425 aa14.68□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 LEUTXA8MZ59 168 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 FAM157AC9JC47 383 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 HPRT1P00492 218 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 SLC25A6P12236 298 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGDIBP52566 201 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 ZFP69Q49AA0 526 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 VMO1Q7Z5L0 202 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 PNKDQ8N490 385 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 LINC01356Q8N9X3 169 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.67□□□□□ -0.06
SYNE4-201ENST00000324444 CACFD1Q9UGQ2 172 aa14.67□□□□□ -0.06
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