RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488087.1

ECHDC1-217, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC1, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-217ENST00000488087 TVP23BQ9NYZ1 205 aa2.76□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 OR1A1Q9P1Q5 309 aa2.76□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 NAGKQ9UJ70 344 aa2.76□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 ANGPT4Q9Y264 503 aa2.76□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa2.76□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 PARP14Q460N5 1801 aa2.76□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 COL4A1P02462 1669 aa2.76□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 ALPK3Q96L96 1907 aa2.76□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 CITO14578 2027 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 A0A1B0GUS0 222 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-217ENST00000488087 IFITM5A6NNB3 132 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-217ENST00000488087 F5H5T6 163 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 H3BN98 237 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-217ENST00000488087 M0R036 132 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 M0R129 80 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 FFAR1O14842 300 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 CCL25O15444 150 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 CYB5BO43169 146 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-217ENST00000488087 SOX15O60248 233 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-217ENST00000488087 RAMP3O60896 148 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 FGF1P05230 155 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 SLC35G6P0C7Q6 338 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 PET100P0DJ07 73 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 GIMD1P0DJR0 217 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 ESDP10768 282 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 GTF2F2P13984 249 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 MSR1P21757 451 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 CCNOP22674 350 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 CD34P28906 385 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-217ENST00000488087 OPRD1P41143 372 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 LPAR6P43657 344 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 EMP2P54851 167 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-217ENST00000488087 TAS2R20P59543 309 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 HIST1H3AP68431 136 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 CSNK1G2P78368 415 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-217ENST00000488087 C5orf64Q2M2E5 130 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-217ENST00000488087 TMEM69Q5SWH9 247 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 OPN5Q6U736 354 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 CLEC18BQ6UXF7 455 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 TEX43Q6ZNM6 134 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF621Q6ZSS3 439 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 FAM220AQ7Z4H9 259 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-217ENST00000488087 DEFB106AQ8N104 65 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 SYS1Q8N2H4 156 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-217ENST00000488087 SLC26A10Q8NG04 563 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-217ENST00000488087 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-217ENST00000488087 OR8B4Q96RC9 309 aa2.75□□□□□ -1.97
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ECHDC1-217ENST00000488087 RNF126Q9BV68 326 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 ULBP1Q9BZM6 244 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 Q9H3A6 140 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 ZNF160Q9HCG1 818 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 CBLN4Q9NTU7 201 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 FKBP11Q9NYL4 201 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 GSKIPQ9P0R6 139 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 ST3GAL6Q9Y274 331 aa2.75□□□□□ -1.97
ECHDC1-217ENST00000488087 ASF1AQ9Y294 204 aa2.75□□□□□ -1.97
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