RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474246.1

SMARCE1-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 2,124 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-208ENST00000474246 OR52D1Q9H346 318 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 ANXA10Q9UJ72 324 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 A0A1B0GV50 99 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 M0R1B8 84 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 NDUFB4O95168 129 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 SHBGP04278 402 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 HLA-DQB2P05538 268 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 HLA-DOAP06340 250 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 GZMBP10144 247 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 TFPIP10646 304 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 CNTFRP26992 372 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 LHX2P50458 406 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 TIMM10P62072 90 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 PPP1CBP62140 327 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 SP4Q02446 784 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 SERPINA11Q86U17 422 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 COX18Q8N8Q8 333 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 PLPP5Q8NEB5 264 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 RXFP2Q8WXD0 754 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 PNPLA2Q96AD5 504 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 GLIPR2Q9H4G4 154 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC25A19Q9HC21 320 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 HEBP1Q9NRV9 189 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 FBXL12Q9NXK8 326 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 TAS2R5Q9NYW4 299 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 DUSP13Q9UII6 198 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 COL6A5A8TX70 2615 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 CENPEQ02224 2701 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 A0A0G2JMM0 328 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 A0A1W2PPB8 328 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF724A8MTY0 619 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 KIR3DP1A8MWS1 328 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 RHODO00212 210 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 PRYO14603 147 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 ARPC2O15144 300 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 CLDN14O95500 239 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 OR2H2O95918 312 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 IGHA1P01876 353 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 NMBP08949 121 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 SCTP09683 121 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 SPNP16150 400 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 BCL3P20749 454 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 ELK3P41970 407 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 GALR1P47211 349 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 PGFP49763 221 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 BTG2P78543 158 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 PSG7Q13046 419 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 UBE2V2Q15819 145 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 ALG10BQ5I7T1 473 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 ENTPD8Q5MY95 495 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 BCL2L15Q5TBC7 163 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 TEPPQ6URK8 271 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 BHLHA9Q7RTU4 235 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 PRSS48Q7RTY5 328 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 CDC20BQ86Y33 519 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM86AQ8N2M4 240 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 OR4C3Q8NH37 302 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 ZPLD1Q8TCW7 415 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 ACY3Q96HD9 319 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 SEC22AQ96IW7 307 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 DERL3Q96Q80 235 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 REEP1Q9H902 201 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 OARD1Q9Y530 152 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 MYH3P11055 1940 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 APCP25054 2843 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 CACNA1FO60840 1977 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 OR2M5A3KFT3 312 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 BTNL10A8MVZ5 291 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 PLAUP00749 431 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 ELANEP08246 267 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 OR12D1P0DN82 309 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 BCKDHAP12694 445 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 NTF3P20783 257 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 OR1D5P58170 312 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 GLYATL3Q5SZD4 288 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 SFTPA2Q8IWL1 248 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM229BQ8NBD8 167 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 PHYHIPLQ96FC7 376 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-208ENST00000474246 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
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