RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCN1O00602 326 aa20.3■□□□□ 0.84
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCUN1D4Q92564 292 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF5Q99942 180 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DUSP21Q9H596 190 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q9N2K0 584 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ISYNA1Q9NPH2 558 aa20.3■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 U3KQK5 164 aa20.3■□□□□ 0.84
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF429Q86V71 674 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R27Q86WC6 154 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASTOR1Q8WTX7 329 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTX4Q96A99 478 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PECRQ9BY49 303 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF221Q9UK13 617 aa20.28■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC01619G3V211 115 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDN12P56749 244 aa20.27■□□□□ 0.84
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PYHIN1Q6K0P9 492 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLCC1Q96S66 551 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC90BQ9GZT6 254 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOLLIPQ9H0E2 274 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAB2Q9UQC2 676 aa20.27■□□□□ 0.84
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CALRP27797 417 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RANBP1P43487 201 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSG5Q15238 335 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACTBL2Q562R1 376 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR56B1Q8NGI3 324 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRG4Q8WWG1 115 aa20.26■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAP30O75446 220 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLURP1P55000 103 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C2orf76Q3KRA6 126 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AKIRIN2Q53H80 203 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF562Q6V9R5 426 aa20.25■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa20.24■□□□□ 0.83
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DENRO43583 198 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPDEFO95238 335 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD40LGP29965 261 aa20.24■□□□□ 0.83
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FABP5Q01469 135 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLAC9Q5JTB6 97 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF383Q8NA42 475 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MGLLQ99685 303 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 V9GY05 133 aa20.24■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa20.23■□□□□ 0.83
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CA2P00918 260 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOA2P02652 100 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV1-16P04430 117 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TFAP2AP05549 437 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMD7P51665 324 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00205P59089 165 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRSS48Q7RTY5 328 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDPNQ86YL7 162 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LFNGQ8NES3 379 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MS4A10Q96PG2 267 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACOT13Q9NPJ3 140 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPSG1Q9NRR2 321 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RDH8Q9NYR8 311 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STAB2Q8WWQ8 2551 aa20.23■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SORL1Q92673 2214 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV3-11P01762 117 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRHBPP24387 322 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPPP2P59282 170 aa20.22■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LDLRAD4O15165 306 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP2K4P45985 399 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINB10P48595 397 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HES5Q5TA89 166 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
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