RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 NPBQ8NG41 125 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 OR8H1Q8NGG4 311 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 OR8U1Q8NH10 309 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 SDHAF2Q9NX18 166 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 OR5H14A6NHG9 310 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 J3QRK9 145 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 FCN1O00602 326 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 NBR2O15453 112 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFA3O95167 84 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 OPN1MWP04001 364 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV1-16P04430 117 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 FCER2P06734 321 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 OPN1MW3P0DN78 364 aa8.44□□□□□ -1.06
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ATG4B-210ENST00000428861 SERPINB10P48595 397 aa8.44□□□□□ -1.06
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ATG4B-210ENST00000428861 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 C1QL4Q86Z23 238 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 GVQW1Q8N7I0 195 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 PHF21AQ96BD5 680 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 R3HDM4Q96D70 268 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 OR2D2Q9H210 308 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 FBXL15Q9H469 300 aa8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 NOTCH3Q9UM47 2321 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 G3V4G9 280 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 M0R1X1 148 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 AP4M1O00189 453 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 PLXNB1O43157 2135 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 WIPF1O43516 503 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 SCGNO76038 276 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 DIRAS3O95661 229 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV2-14P01704 120 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 TFAP2AP05549 437 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 ALDH3B2P48448 385 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 ARL6IP1Q15041 203 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 CTF1Q16619 201 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 FOXRED2Q8IWF2 684 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 GHITMQ9H3K2 345 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 AUNIPQ9H7T9 357 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF221Q9UK13 617 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 GAB2Q9UQC2 676 aa8.43□□□□□ -1.06
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ATG4B-210ENST00000428861 FBXO7Q9Y3I1 522 aa8.43□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.42□□□□□ -1.06
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ATG4B-210ENST00000428861 G3V318 75 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 H7C2Y5 167 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 RRHO14718 337 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 GABARAPO95166 117 aa8.42□□□□□ -1.06
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ATG4B-210ENST00000428861 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 CNIH2Q6PI25 160 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 ETV3LQ6ZN32 361 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 SAMD12Q8N8I0 201 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 SNAPC3Q92966 411 aa8.42□□□□□ -1.06
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ATG4B-210ENST00000428861 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.42□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.42□□□□□ -1.06
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ATG4B-210ENST00000428861 A0A0A6YYH2 397 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 A6NJ64 397 aa8.41□□□□□ -1.06
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ATG4B-210ENST00000428861 ATP6V0E1O15342 81 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 XRCC3O43542 346 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM127O75204 238 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV2-23P01705 113 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 HLA-DQB1P01920 261 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 MC5RP33032 325 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 PITPNAQ00169 270 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2NLQ5JXB2 153 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 GPR107Q5VW38 600 aa8.41□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 LIN54Q6MZP7 749 aa8.41□□□□□ -1.06
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