RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 FAM25AB3EWG3 89 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 FAM25CB3EWG5 89 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 FAM25GB3EWG6 89 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 LDLRAD4O15165 306 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 APOA1P02647 267 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 ZBTB25P24278 435 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 TALDO1P37837 337 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 THBS3P49746 956 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 F2RL1P55085 397 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 TMEM50BP56557 158 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 C2orf76Q3KRA6 126 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 MFSD4AQ8N468 514 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 LINC00482Q8N8I6 264 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 LGALS14Q8TCE9 139 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 IL1F10Q8WWZ1 152 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 BORCS5Q969J3 196 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 DIRAS2Q96HU8 199 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 MIXL1Q9H2W2 232 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 IFI27L2Q9H2X8 130 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 SLC23A1Q9UHI7 598 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 RAB22AQ9UL26 194 aa15.99■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 NOTCH3Q9UM47 2321 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 PLXNB1O43157 2135 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 SOCS1O15524 211 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 IGLL1P15814 213 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 MC5RP33032 325 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 P2RY14Q15391 338 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 MMDQ15546 238 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 UBE2NLQ5JXB2 153 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 ZNF695Q8IW36 515 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 NPBQ8NG41 125 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 PTX4Q96A99 478 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 AGMATQ9BSE5 352 aa15.98■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 LINC01548A6NM66 108 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 IGHG4P01861 327 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 HLA-DRB1P01911 266 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 CD40LGP29965 261 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 ACTBP60709 375 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 CFHR3Q02985 330 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 RNF5Q99942 180 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 ZNF251Q9BRH9 671 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 KCNK15Q9H427 330 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 Q9N2K0 584 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 AK3Q9UIJ7 227 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 LINC00527Q9UJ94 153 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 RABL2BQ9UNT1 228 aa15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 OR5H14A6NHG9 310 aa15.96■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 DIRAS3O95661 229 aa15.96■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 VDAC1P21796 283 aa15.96■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 VEGFCP49767 419 aa15.96■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 PPP5CP53041 499 aa15.96■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 CLDN12P56749 244 aa15.96■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 HLA-DRB3P79483 266 aa15.96■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 Q6ZPA2 131 aa15.96■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 OR5H6Q8NGV6 325 aa15.96■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 CYYR1Q96J86 154 aa15.96■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 P2RX4Q99571 388 aa15.96■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 PECRQ9BY49 303 aa15.96■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PITX3-201ENST00000370002 A0A0B4J203 849 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 FABP12A6NFH5 140 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 NBR2O15453 112 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 RBBP9O75884 186 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 NDUFA3O95167 84 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 ELK1P19419 428 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 CNIH2Q6PI25 160 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 FAM131AQ6UXB0 335 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 ETV3LQ6ZN32 361 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 SETD6Q8TBK2 473 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 TOLLIPQ9H0E2 274 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 PALMDQ9NP74 551 aa15.95■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 NUDT19A8MXV4 375 aa15.94■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 RAB6AP20340 208 aa15.94■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 CEACAM6P40199 344 aa15.94■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 OR3A3P47888 321 aa15.94■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa15.94■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 KIR2DS1Q14954 304 aa15.94■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 C5orf64Q2M2E5 130 aa15.94■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 C5orf24Q7Z6I8 188 aa15.94■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa15.94■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 HSPB9Q9BQS6 159 aa15.94■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PITX3-201ENST00000370002 KIAA1456Q9P272 454 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms