RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	AKAIN1	P0CW23	69 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	PAX6	P26367	422 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	GPR157	Q5UAW9	335 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	TRIQK	Q629K1	86 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	OR56B4	Q8NH76	319 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	NANP	Q8TBE9	248 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	MOB3A	Q96BX8	217 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	NUP50	Q9UKX7	468 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		10.19	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667		A0A1W2PPI3	338 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	OR5H14	A6NHG9	310 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	OR8U9	P0C7N5	309 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	OR3A3	P47888	321 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	MEF2D	Q14814	521 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	FBLN7	Q53RD9	439 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	OR8U1	Q8NH10	309 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	TSC22D3	Q99576	134 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	OR2D2	Q9H210	308 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		10.18	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	AMY2A	P04746	511 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	EPHA1	P21709	976 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	HTR1D	P28221	377 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	AP3S2	P59780	193 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	LYG1	Q8N1E2	194 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		10.17	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	TOR1A	O14656	332 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	HSD17B6	O14756	317 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	RAB7A	P51149	207 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	FXYD4	P59646	89 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	BPIFB3	P59826	476 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	ASAH1	Q13510	395 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	TMEM17	Q86X19	198 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	TEX29	Q8N6K0	151 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	DPM3	Q9P2X0	92 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	RNF150	Q9ULK6	438 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	HNF1A	P20823	631 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	GNRHR	P30968	328 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	REG1B	P48304	166 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	PRRX1	P54821	245 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	LINC00205	P59089	165 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	DRAM1	Q8N682	238 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	CFHR4	Q92496	578 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	MCUB	Q9NWR8	336 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	JMJD1C	Q15652	2540 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DNMT1-208	ENST00000586667	VGLL3	A8MV65	326 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DNMT1-208	ENST00000586667	LEUTX	A8MZ59	168 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DNMT1-208	ENST00000586667	RAB29	O14966	203 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DNMT1-208	ENST00000586667	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
DNMT1-208	ENST00000586667	GPR12	P47775	334 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DNMT1-208	ENST00000586667	UCP3	P55916	312 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DNMT1-208	ENST00000586667	HERV-K104	P61576	105 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DNMT1-208	ENST00000586667	BAMBI	Q13145	260 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DNMT1-208	ENST00000586667	MSMO1	Q15800	293 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DNMT1-208	ENST00000586667	SSX2	Q16385	188 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DNMT1-208	ENST00000586667	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DNMT1-208	ENST00000586667	TERB2	Q8NHR7	220 aa		10.14	□□□□□ -0.79

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