RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 HNF4GQ14541 408 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 ZNF260Q3ZCT1 412 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 CDNFQ49AH0 187 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 C11orf87Q6NUJ2 197 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 SNX29P2Q8IUI4 249 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 DRAM1Q8N682 238 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 OR9G1Q8NH87 305 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 MRGPRDQ8TDS7 321 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 S100ZQ8WXG8 99 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 TOMM40LQ969M1 308 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 RPEQ96AT9 228 aa10□□□□□ -0.81
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PRAME-212ENST00000485532 SRRQ9GZT4 340 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 HSF4Q9ULV5 492 aa10□□□□□ -0.81
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PRAME-212ENST00000485532 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 SSTR5P35346 364 aa9.99□□□□□ -0.81
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PRAME-212ENST00000485532 ZNF846Q147U1 533 aa9.99□□□□□ -0.81
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PRAME-212ENST00000485532 ATAD3CQ5T2N8 411 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 PYHIN1Q6K0P9 492 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.99□□□□□ -0.81
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PRAME-212ENST00000485532 UBALD1Q8TB05 177 aa9.99□□□□□ -0.81
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PRAME-212ENST00000485532 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 SPACA1Q9HBV2 294 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
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PRAME-212ENST00000485532 RABL2BQ9UNT1 228 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 LINC01548A6NM66 108 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 OOSP1A8MZH6 123 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 J3QRK9 145 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 GLAP06280 429 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 TMEM11P17152 192 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 DGCR2P98153 550 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 PYDC2Q56P42 97 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 C5orf56Q8N8D9 126 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 ZNF565Q8N9K5 539 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 DUX3Q96PT4 197 aa9.98□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
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PRAME-212ENST00000485532 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 UBE2QL1A1L167 161 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 SERPINE3A8MV23 424 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 M0QZK8 103 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 CTDSPLO15194 276 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 SSX5O60225 188 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 CA11O75493 328 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 IGKV1D-33P01593 117 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 IGKV1-33P01594 117 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 REG1BP48304 166 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 ARL6IP1Q15041 203 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 HACD4Q5VWC8 232 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 GDPD1Q8N9F7 314 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 SMIM4Q8WVI0 70 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.97□□□□□ -0.81
PRAME-212ENST00000485532 MCRIP1C9JLW8 97 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 CD40LGP29965 261 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 PRSS3P35030 304 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 THBS3P49746 956 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 PPP5CP53041 499 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 GNG2P59768 71 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 PITPNAQ00169 270 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 VAX1Q5SQQ9 334 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 LCNL1Q6ZST4 164 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 OR52I2Q8NH67 350 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 NEK7Q8TDX7 302 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 GPX8Q8TED1 209 aa9.96□□□□□ -0.82
PRAME-212ENST00000485532 C15orf40Q8WUR7 153 aa9.96□□□□□ -0.82
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