RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 RNF150Q9ULK6 438 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 METTL21EPA6NDL7 271 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 M0QZK8 103 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 ITGB1BP1O14713 200 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 FABP7O15540 132 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 FGF16O43320 207 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 TXNL1O43396 289 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 RGS11O94810 467 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 MOSP00540 346 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 CSF1P09603 554 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 CT45A6P0DMU7 189 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 CT45A5P0DMU8 189 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 CT45A7P0DMV0 189 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 RANBP1P43487 201 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 CD83Q01151 205 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 CDNFQ49AH0 187 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 IDNKQ5T6J7 187 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 DTX3Q8N9I9 347 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 C5orf30Q96GV9 206 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 S1PR3Q99500 378 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 RDH8Q9NYR8 311 aa8.49□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM235A6NFC5 223 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 SERPINE3A8MV23 424 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 AIREO43918 545 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 SSX5O60225 188 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 PEX14O75381 377 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 IGHG2P01859 326 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 ZBTB25P24278 435 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 RPS19P39019 145 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF260Q3ZCT1 412 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF329Q86UD4 541 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 FUNDC2Q9BWH2 189 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 ABCG5Q9H222 651 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 PIPOXQ9P0Z9 390 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.48□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 RAB29O14966 203 aa8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 BET1O15155 118 aa8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 HSPA12AO43301 675 aa8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 RRP9O43818 475 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 PTHLHP12272 177 aa8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 GPR12P47775 334 aa8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 ACTBP60709 375 aa8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 NCS1P62166 190 aa8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 ARFRP1Q13795 201 aa8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 HACD4Q5VWC8 232 aa8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 OR13F1Q8NGS4 319 aa8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 NOTCH1P46531 2555 aa8.46□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1W2PRX2 142 aa8.46□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 H0YJW9 148 aa8.46□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 DTYMKP23919 212 aa8.46□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.061e-6■□□□□ 11.2
ATG4B-210ENST00000428861 FAM131AQ6UXB0 335 aa8.46□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZS49 121 aa8.46□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.46□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 SLC35E3Q7Z769 313 aa8.46□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF383Q8NA42 475 aa8.46□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa8.46□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.46□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 SPATA2Q9UM82 520 aa8.46□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 ETV7Q9Y603 341 aa8.46□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV18A0A075B6X5 111 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 PSMB11A5LHX3 300 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 KCNAB3O43448 404 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 OR8U9P0C7N5 309 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 TALDO1P37837 337 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 SCAND1P57086 179 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 VBP1P61758 197 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 CFHR3Q02985 330 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 KIR2DS1Q14954 304 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 MMDQ15546 238 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ATG4B-210ENST00000428861 STPG2Q8N412 459 aa8.45□□□□□ -1.06
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