RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 PTX4Q96A99 478 aa14.85□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.85□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa14.84□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 METTL21EPA6NDL7 271 aa14.84□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 TRIM64CA6NLI5 447 aa14.84□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 YPEL1O60688 119 aa14.84□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 AMY1AP04745 511 aa14.84□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 AMY2AP04746 511 aa14.84□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 SCTP09683 121 aa14.84□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 VSIG10L2P0DP72 767 aa14.84□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.84□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 STEAP3Q658P3 488 aa14.84□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 AKR1E2Q96JD6 320 aa14.84□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 YPEL2Q96QA6 119 aa14.84□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 MFNGO00587 321 aa14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 AIREO43918 545 aa14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 CD3GP09693 182 aa14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM11P17152 192 aa14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF137PP52743 207 aa14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 HLA-DRB3P79483 266 aa14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 C11orf88Q6PI97 169 aa14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 ODF3L1Q8IXM7 274 aa14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 C11orf44Q8N8P7 122 aa14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 DTX3Q8N9I9 347 aa14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 LGALS14Q8TCE9 139 aa14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 OR1A1Q9P1Q5 309 aa14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 RGS11O94810 467 aa14.82□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa14.82□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 PRR31Q5SQ13 230 aa14.82□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.82□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 IDNKQ5T6J7 187 aa14.82□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.82□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.82□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 TRDCB7Z8K6 153 aa14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 ST8SIA5O15466 376 aa14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 LANCL1O43813 399 aa14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 LPLP06858 475 aa14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 FCGR3AP08637 254 aa14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 SMIM18P0DKX4 95 aa14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 OR3A3P47888 321 aa14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 EBI3Q14213 229 aa14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 HERPUD1Q15011 391 aa14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 OR5H6Q8NGV6 325 aa14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 MAFIPQ8WZ33 124 aa14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 MGAT4AQ9UM21 535 aa14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.81□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 VWFP04275 2813 aa14.8□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 SERPINE3A8MV23 424 aa14.8□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 CD1BP29016 333 aa14.8□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 CEACAM6P40199 344 aa14.8□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 CDNFQ49AH0 187 aa14.8□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.8□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.8□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa14.79□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 M0QZK8 103 aa14.79□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 HSPA12AO43301 675 aa14.79□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 TXNL1O43396 289 aa14.79□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 PEX14O75381 377 aa14.79□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 ZBTB25P24278 435 aa14.79□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 RPS19P39019 145 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 ARFRP1Q13795 201 aa14.79□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa14.79□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 Q8N6K4 173 aa14.79□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 C5orf56Q8N8D9 126 aa14.79□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.79□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 FUNDC2Q9BWH2 189 aa14.79□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 RHBDL2Q9NX52 303 aa14.79□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 GSTT2P0CG29 244 aa14.78□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 GSTT2BP0CG30 244 aa14.78□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 CD28P10747 220 aa14.78□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 IGSF11Q5DX21 431 aa14.78□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 OR13F1Q8NGS4 319 aa14.78□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC25A38Q96DW6 304 aa14.78□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.78□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
GCSHP2-201ENST00000560971 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
GCSHP2-201ENST00000560971 M0QZ24 198 aa14.77□□□□□ -0.05
GCSHP2-201ENST00000560971 FABP7O15540 132 aa14.77□□□□□ -0.05
GCSHP2-201ENST00000560971 MOSP00540 346 aa14.77□□□□□ -0.05
GCSHP2-201ENST00000560971 TALDO1P37837 337 aa14.77□□□□□ -0.05
GCSHP2-201ENST00000560971 LSAMPQ13449 338 aa14.77□□□□□ -0.05
GCSHP2-201ENST00000560971 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.1 ms