RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	SVOP	Q8N4V2	548 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	RITA1	Q96K30	269 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	DUX3	Q96PT4	197 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	YPEL2	Q96QA6	119 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	DUSP21	Q9H596	190 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		9.37	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	NUDT19	A8MXV4	375 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	SRM	P19623	302 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	CNTFR	P26992	372 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	PSMB8	P28062	276 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	OR3A3	P47888	321 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	TPBG	Q13641	420 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	VCX	Q9H320	206 aa		9.36	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	BPNT1	O95861	308 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	ELANE	P08246	267 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	MYF6	P23409	242 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	SOX6	P35712	828 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	FHL3	Q13643	280 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	MED22	Q15528	200 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	MMD	Q15546	238 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	DEFB136	Q30KP8	78 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM203	Q969S6	136 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	CCL24	O00175	119 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC17A2	O00624	439 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	SOCS1	O15524	211 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	NDUFA3	O95167	84 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	HLA-DRB1	P01911	266 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM50B	P56557	158 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	ACTB	P60709	375 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	NDP	Q00604	133 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	KIR2DS1	Q14954	304 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	UFD1	Q92890	307 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	GALM	Q96C23	342 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	KCTD7	Q96MP8	289 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	SCN3B	Q9NY72	215 aa		9.34	□□□□□ -0.91
PTPRF-211	ENST00000467464	COL7A1	Q02388	2944 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	LDLRAD4	O15165	306 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	ATP6V0E1	O15342	81 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	ST8SIA5	O15466	376 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	PROP1	O75360	226 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	IGLV1-40	P01703	118 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	CRHBP	P24387	322 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	PLA2G7	Q13093	441 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	P2RY14	Q15391	338 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	NPB	Q8NG41	125 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	OR8U1	Q8NH10	309 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	GON7	Q9BXV9	100 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	KLK15	Q9H2R5	256 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	AK3	Q9UIJ7	227 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	LRRC42	Q9Y546	428 aa		9.33	□□□□□ -0.92
PTPRF-211	ENST00000467464	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		9.32	□□□□□ -0.92

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms