RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 JPT1Q9UK76 154 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 SSR3Q9UNL2 185 aa8.54□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 MFNGO00587 321 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 ST8SIA5O15466 376 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 YPEL1O60688 119 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM11P17152 192 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 RAB6AP20340 208 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 ARHGDIBP52566 201 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 HLA-DRB3P79483 266 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 MXD1Q05195 221 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 HES1Q14469 280 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 SFXN4Q6P4A7 337 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 C11orf88Q6PI97 169 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 IZUMO1Q8IYV9 350 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 GALMQ96C23 342 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 YIPF6Q96EC8 236 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 RITA1Q96K30 269 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 KCTD7Q96MP8 289 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 YPEL2Q96QA6 119 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 RAB9BQ9NP90 201 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 PLSCR3Q9NRY6 295 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.53□□□□□ -1.04
ATG4B-210ENST00000428861 A0A075B6Q4 140 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 LINC01548A6NM66 108 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 CD3GP09693 182 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 IL3RAP26951 378 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 LY6G6FQ5SQ64 297 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 STEAP3Q658P3 488 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 TPRA1Q86W33 373 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 OR5H6Q8NGV6 325 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 MAFIPQ8WZ33 124 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 RAB3CQ96E17 227 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 AGMATQ9BSE5 352 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 C12orf4Q9NQ89 552 aa8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 A0A087WXM4 84 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 M0QZ24 198 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 LANCL1O43813 399 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 PROP1O75360 226 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 TNFAIP8O95379 198 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 FCGR3AP08637 254 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 GSTT2P0CG29 244 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 GSTT2BP0CG30 244 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 SMIM18P0DKX4 95 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 CD1BP29016 333 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 F2RL1P55085 397 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 LSAMPQ13449 338 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 MOB1BQ7L9L4 216 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 Q8N9W7 124 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 PTX4Q96A99 478 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 ABHD14BQ96IU4 210 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 AKR1E2Q96JD6 320 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 NABP2Q9BQ15 211 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 ATG5Q9H1Y0 275 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 ABRACLQ9P1F3 81 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.51□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 TRDCB7Z8K6 153 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 FBXO24O75426 580 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 CNTFRP26992 372 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 CEACAM6P40199 344 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 LINC00205P59089 165 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 IGSF11Q5DX21 431 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 OR5AU1Q8NGC0 362 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A38Q96DW6 304 aa8.5□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
ATG4B-210ENST00000428861 MMP27Q9H306 513 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms