RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258947.7

CALCOCO2-201, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CALCOCO2, Length 3,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2-201ENST00000258947 SNX22Q96L94 193 aa7.3□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.3□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.3□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 ZZEF1O43149 2961 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 E5RGE8 158 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 H0YIZ8 118 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 M0R1X1 148 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 CST7O76096 145 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 PLAUP00749 431 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 THBDP07204 575 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 IAPPP10997 89 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 LPAR6P43657 344 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 KCNJ3P48549 501 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 HFEQ30201 348 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 GALNT14Q96FL9 552 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 CACNG5Q9UF02 275 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 NSG2Q9Y328 171 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 PPIAL4EA0A075B759 164 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 PPIAL4DF5H284 164 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 IFNL4K9M1U5 179 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 ZG16O60844 167 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 PPIAL4FP0DN26 164 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 SLC25A4P12235 298 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 GZMHP20718 246 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 VDAC1P21796 283 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 PCSK4Q6UW60 755 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 LYG1Q8N1E2 194 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 MUC15Q8N387 334 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 DRAM1Q8N682 238 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 DBX1A6NMT0 343 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 AGPAT2O15120 278 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 LYNX1P0DP58 116 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 TMEM65Q6PI78 240 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 FAM210AQ96ND0 272 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.29□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 RNF222A6NCQ9 220 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 NDUFB3O43676 98 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 FCGR3BO75015 233 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 HLA-GP17693 338 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 ZNF616Q08AN1 781 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 BAP18Q8IXM2 172 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 OR10Z1Q8NGY1 313 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 RAB9BQ9NP90 201 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 P2RX3P56373 397 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 TMEM33P57088 247 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 SHEQ5VZ18 495 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 FBXL17Q9UF56 701 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 H0Y980 276 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 IFNA17P01571 189 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 SPINK9Q5DT21 86 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 STX12Q86Y82 276 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 CXorf58Q96LI9 332 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 CLCC1Q96S66 551 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 RNF126Q9BV68 326 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 HRH4Q9H3N8 390 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 CALYQ9NYX4 217 aa7.28□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.27□□□□□ -1.24
CALCOCO2-201ENST00000258947 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CALCOCO2-201ENST00000258947 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.27□□□□□ -1.25
CALCOCO2-201ENST00000258947 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.27□□□□□ -1.25
CALCOCO2-201ENST00000258947 E7EQL1 145 aa7.27□□□□□ -1.25
CALCOCO2-201ENST00000258947 G6PCP35575 357 aa7.27□□□□□ -1.25
CALCOCO2-201ENST00000258947 ERVK-16P61578 105 aa7.27□□□□□ -1.25
CALCOCO2-201ENST00000258947 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CALCOCO2-201ENST00000258947 TESK1Q15569 626 aa7.27□□□□□ -1.25
CALCOCO2-201ENST00000258947 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms