RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	SOX15	O60248	233 aa		9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	HLA-DRB1	P01911	266 aa		9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	HBZ	P02008	142 aa		9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	CD2	P06729	351 aa		9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	SPN	P16150	400 aa		9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	SLURP1	P55000	103 aa		9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB40B	Q12829	278 aa		9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	GAPT	Q8N292	157 aa		9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	CBR4	Q8N4T8	237 aa		9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	OR51J1	Q9H342	316 aa		9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		9.24	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	LCE6A	A0A183	80 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	OVOL1	O14753	267 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	SPINT2	O43291	252 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	LANCL1	O43813	399 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	SAP30	O75446	220 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	LALBA	P00709	142 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	GTF2F2	P13984	249 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	BDKRB2	P30411	391 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	ACTB	P60709	375 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP3R1	P63098	170 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF429	Q86V71	674 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	ETAA1	Q9NY74	926 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		9.23	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	LYL1	P12980	280 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	GP9	P14770	177 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	ETV1	P50549	477 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB9A	P51151	201 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	RIPK1	Q13546	671 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	C6orf183	Q5T699	404 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB12	Q6IQ22	244 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM65	Q6PI78	240 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	STX19	Q8N4C7	294 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	ARPC1A	Q92747	370 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	MUL1	Q969V5	352 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	S100A13	Q99584	98 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	NABP2	Q9BQ15	211 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087WW49	117 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	NBR2	O15453	112 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	SC5D	O75845	299 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	OR3A3	P47888	321 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	ECSCR	Q19T08	205 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC58	Q4VC31	144 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	MORN2	Q502X0	79 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	STEAP3	Q658P3	488 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM19	Q96E16	107 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338		Q96MT0	163 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	CITED4	Q96RK1	184 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	BANF2	Q9H503	90 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2QL1	A1L167	161 aa		9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC01619	G3V211	115 aa		9.2	□□□□□ -0.94
TTLL3-233	ENST00000602338	OGG1	O15527	345 aa		9.2	□□□□□ -0.94

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