RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567060.5

CLN6-208, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, human

TSL 2

Gene CLN6, Length 945 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLN6-208	ENST00000567060	LINC00311	Q8N616	119 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	RFESD	Q8TAC1	157 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	SETD6	Q8TBK2	473 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	YPEL2	Q96QA6	119 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	GHITM	Q9H3K2	345 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	CTDSP2	O14595	271 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	TOR1A	O14656	332 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	ITGB1BP1	O14713	200 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	IGLV1-47	P01700	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	FBP1	P09467	338 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	OMG	P23515	440 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	ZBTB25	P24278	435 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	NFYB	P25208	207 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	S100A5	P33763	92 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	PRSS3	P35030	304 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	MALSU1	Q96EH3	234 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	JMJD8	Q96S16	334 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	GNG12	Q9UBI6	72 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	ZNF69	Q9UC07	566 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CLN6-208	ENST00000567060	OOSP1	A8MZH6	123 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	FABP7	O15540	132 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	HLA-DQB1	P01920	261 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	ARG1	P05089	322 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	COX7A1	P24310	79 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	HTR1D	P28221	377 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	SAA4	P35542	130 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	GDNF	P39905	211 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	CEACAM3	P40198	252 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	KLRD1	Q13241	179 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	AANAT	Q16613	207 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060		Q6ZPA2	131 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	OR1L1	Q8NH94	360 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	MMP28	Q9H239	520 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	MEIOC	A2RUB1	952 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060		J3QR06	171 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	SSX5	O60225	188 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	LPL	P06858	475 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	IL3RA	P26951	378 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	ARHGDIB	P52566	201 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	MORN2	Q502X0	79 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	CNIH2	Q6PI25	160 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	LAX1	Q8IWV1	398 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	PRR18	Q8N4B5	295 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	DPM3	Q9P2X0	92 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	PSG11	Q9UQ72	335 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	LEUTX	A8MZ59	168 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	CTDSPL	O15194	276 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	RAB7A	P51149	207 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	TMEM86B	Q8N661	226 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	GPX8	Q8TED1	209 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	IFT46	Q9NQC8	304 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	HSPA12A	O43301	675 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	SCT	P09683	121 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	NAT1	P18440	290 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	ZNF137P	P52743	207 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	ACTB	P60709	375 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	ACTG1	P63261	375 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CLN6-208	ENST00000567060	MADCAM1	Q13477	382 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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