RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF702PQ9H963 129 aa14.91□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 RAB9BQ9NP90 201 aa14.91□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 HSF4Q9ULV5 492 aa14.91□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A087WXM4 84 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A1W2PPI3 338 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 TIMM23O14925 209 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 RANBP1P43487 201 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 REG1BP48304 166 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 BLCAPP62952 87 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 GNMTQ14749 295 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 MOGAT2Q3SYC2 334 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 Q6ZS46 218 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 LINC00311Q8N616 119 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 DRAM1Q8N682 238 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 OCSTAMPQ9BR26 566 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.9□□□□□ -0.02
GCSHP2-201ENST00000560971 NOTOA8MTQ0 251 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 HSD17B6O14756 317 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 CLEC2LP0C7M8 214 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 SDC2P34741 201 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 MXD1Q05195 221 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 HMGN3Q15651 99 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 TPRA1Q86W33 373 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 OR56B4Q8NH76 319 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 CFHR4Q92496 578 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 KCTD7Q96MP8 289 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 CITED1Q99966 193 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 CENPOQ9BU64 300 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF696Q9H7X3 374 aa14.89□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 RAB7AP51149 207 aa14.88□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 Q3ZCU0 254 aa14.88□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 MORN2Q502X0 79 aa14.88□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.88□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 GALMQ96C23 342 aa14.88□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.88□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 DAPK2Q9UIK4 370 aa14.88□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 KCNK7Q9Y2U2 307 aa14.88□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM106CPP0CH98 169 aa14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 RAB6AP20340 208 aa14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 HTD2P86397 168 aa14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 MOB3BQ86TA1 216 aa14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 OR8H3Q8N146 312 aa14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 Q8N2B8 174 aa14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 OR10R2Q8NGX6 335 aa14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 RAB3CQ96E17 227 aa14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 ABRACLQ9P1F3 81 aa14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 JPT1Q9UK76 154 aa14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.87□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 RAB27BO00194 218 aa14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 OR2F2O95006 317 aa14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 GNB3P16520 340 aa14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 SFXN4Q6P4A7 337 aa14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 YIPF6Q96EC8 236 aa14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 ATG5Q9H1Y0 275 aa14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 Q9N2K0 584 aa14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 SERTAD4Q9NUC0 356 aa14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa14.86□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A075B6Q4 140 aa14.85□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.85□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 IGKV1D-33P01593 117 aa14.85□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 IGKV1-33P01594 117 aa14.85□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 IL3RAP26951 378 aa14.85□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 TGFBR1P36897 503 aa14.85□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 HES1Q14469 280 aa14.85□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 HNF4GQ14541 408 aa14.85□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.85□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 C16orf82Q7Z2V1 217 aa14.85□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 LYG1Q8N1E2 194 aa14.85□□□□□ -0.03
GCSHP2-201ENST00000560971 KLHDC1Q8N7A1 406 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms