RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANOS1	P23352	680 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR1D4	P47884	311 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLDN15	P56746	228 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	NOG	Q13253	232 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	VGLL4	Q14135	290 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM166A	Q6J272	317 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPSB1	Q96BD6	273 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	LMLN	Q96KR4	655 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	S1PR5	Q9H228	398 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A087WV48	116 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	LMO1	P25800	156 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR183	P32249	361 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	GNG4	P50150	75 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	GFRA1	P56159	465 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	CARD17	Q5XLA6	110 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	SI	P14410	1827 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFB4	O95168	129 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRNP	P04156	253 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL12B	P29460	328 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	NTSR1	P30989	418 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR3A4P	P47883	348 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	FLT3LG	P49771	235 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	EMD	P50402	254 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	DOK3	Q7L591	496 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	MUC15	Q8N387	334 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	DGAT2	Q96PD7	388 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549		J3QR06	171 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	MPPED1	O15442	326 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL15RA	Q13261	267 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	UNC119	Q13432	240 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	TXNDC8	Q6A555	127 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	C5orf30	Q96GV9	206 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		7.1	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR75	O95800	540 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	KLKB1	P03952	638 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPY1R	P25929	384 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSG3	Q16557	428 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM177	Q53S58	311 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PARM1	Q6UWI2	310 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2D2	Q9H210	308 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	HS3ST1	O14792	307 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	SH2D1B	O14796	132 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPEM2	Q0P670	501 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q0VG73	95 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD226	Q15762	336 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEFB125	Q8N687	156 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	BORCS8	Q96FH0	119 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL36B	Q9NZH7	164 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	LAMA3	Q16787	3333 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	ALG1L2	C9J202	215 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	CRYAA	P02489	173 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	F2R	P25116	425 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLRN1	P58418	232 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCL15	Q16663	113 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	BATF2	Q8N1L9	274 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		7.09	□□□□□ -1.27

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