RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 LY6G6FQ5SQ64 297 aa9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 GPR157Q5UAW9 335 aa9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 Q8N402 240 aa9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 C8orf31Q8N9H6 132 aa9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR52I2Q8NH67 350 aa9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR1L1Q8NH94 360 aa9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 NANPQ8TBE9 248 aa9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM216AQ8WUB2 273 aa9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 IL1F10Q8WWZ1 152 aa9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR2S2Q9NQN1 319 aa9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 GFOD1Q9NXC2 390 aa9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 HSPA12AO43301 675 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 CSF1P09603 554 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 SCTP09683 121 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 GSTT2P0CG29 244 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 GSTT2BP0CG30 244 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 NFYBP25208 207 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 UBE2E1P51965 193 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 DGCR2P98153 550 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 SCGB2A2Q13296 93 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF79Q15937 498 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 MFSD4AQ8N468 514 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 GVQW1Q8N7I0 195 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR11H6Q8NGC7 330 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR5AP2Q8NGF4 316 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR9G1Q8NH87 305 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR10J5Q8NHC4 309 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF596Q8TC21 504 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 DEDD2Q8WXF8 326 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 MAFIPQ8WZ33 124 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 SNAPC3Q92966 411 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 CREB3L1Q96BA8 519 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 SUCNR1Q9BXA5 334 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 CLEC7AQ9BXN2 247 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 SRRQ9GZT4 340 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.35□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 MEIS3P1A6NDR6 274 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 TOR1AO14656 332 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 ITGB1BP1O14713 200 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 YPEL1O60688 119 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 MMP23AO75900 390 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 CD40LGP29965 261 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRRX1P54821 245 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 TAS2R19P59542 299 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 AP3S2P59780 193 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 HERPUD1Q15011 391 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 LTC4SQ16873 150 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 MIDNQ504T8 468 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM120AOSQ5T036 256 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF626Q68DY1 528 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 ABHD12Q8N2K0 398 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 BEND2Q8NDZ0 799 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR2AK2Q8NG84 335 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR5H2Q8NGV7 314 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 UBALD1Q8TB05 177 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 LHX4Q969G2 390 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 YPEL2Q96QA6 119 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 GINS4Q9BRT9 223 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 CCDC32Q9BV29 185 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 TOLLIPQ9H0E2 274 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 GHITMQ9H3K2 345 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 KLK11Q9UBX7 282 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa9.34□□□□□ -0.91
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 ODF3BA8MYP8 253 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 BET1O15155 118 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 AVPP01185 164 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 FSHBP01225 129 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGHV1-69P01742 117 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 COX7A1P24310 79 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 GDNFP39905 211 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 CEACAM6P40199 344 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR3A3P47888 321 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 RAB7AP51149 207 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF846Q147U1 533 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 MEF2DQ14814 521 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 CDK10Q15131 360 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 MORN2Q502X0 79 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGSF11Q5DX21 431 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRIQKQ629K1 86 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 HCP5Q6MZN7 132 aa9.33□□□□□ -0.92
ARHGEF3-211ENST00000486829 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.4 ms