RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477234.1

SBF1-208, Transcript of SET binding factor 1, human

TSL 5

Gene SBF1, Length 947 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF1-208	ENST00000477234	NPBWR2	P48146	333 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	VEGFC	P49767	419 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	HCP5	Q6MZN7	132 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	RAB3C	Q96E17	227 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	KCNK15	Q9H427	330 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	NLK	Q9UBE8	527 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	RAB27B	O00194	218 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	SULT1C2	O00338	296 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	CTDSPL	O15194	276 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	PDCD6	O75340	191 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	JTB	O76095	146 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	GABRR1	P24046	479 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	MYCNOS	P40205	109 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	ARHGDIB	P52566	201 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	DLX1	P56177	255 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	PIGY	Q3MUY2	71 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	TMEM219	Q86XT9	240 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	FGFRL1	Q8N441	504 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	ZMAT4	Q9H898	229 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	RYR2	Q92736	4967 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234		A0A1B0GW55	424 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234		A0A1W2PP11	408 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	OR2AT4	A6NND4	320 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	DEGS1	O15121	323 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	CA11	O75493	328 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF44	P15621	663 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	PRSS3	P35030	304 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	CBX5	P45973	191 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	KCNJ3	P48549	501 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	THBS3	P49746	956 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	PPP5C	P53041	499 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	TAS2R20	P59543	309 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	BLCAP	P62952	87 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	CDNF	Q49AH0	187 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	PYDC2	Q56P42	97 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF488	Q96MN9	340 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	RCHY1	Q96PM5	261 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	NICN1	Q9BSH3	213 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	CCDC32	Q9BV29	185 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	ZFP57	Q9NU63	452 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	DUX4	Q9UBX2	424 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234		V9GYH0	126 aa		9.81	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	SORL1	Q92673	2214 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234		M0QZK8	103 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	HAND1	O96004	215 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	GNG2	P59768	71 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	ACTB	P60709	375 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	GMFB	P60983	142 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	PLA2G7	Q13093	441 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	HACD4	Q5VWC8	232 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	MFSD4A	Q8N468	514 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF561	Q8N587	486 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	NEK7	Q8TDX7	302 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	BORCS5	Q969J3	196 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	GAFA1	Q96PS6	74 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	SOST	Q9BQB4	213 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	PECR	Q9BY49	303 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		9.8	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	FUOM	A2VDF0	154 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		9.79	□□□□□ -0.84
SBF1-208	ENST00000477234		F8VVB4	439 aa		9.79	□□□□□ -0.84

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