RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263966.7

USP13-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP13, Length 8,323 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-201ENST00000263966 Q7L0L9 218 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 PRSS50Q9UI38 385 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 PDFQ9HBH1 243 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 SCN7AQ01118 1682 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 SNURFLB1AK76 121 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 H3BMH7 237 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 CDIPTO14735 213 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 HYPMO75409 117 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 NKG7Q16617 165 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 ASB10Q8WXI3 467 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 APCSP02743 223 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 PMELP40967 661 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 DLX6P56179 175 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 KIR2DL4Q99706 377 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 RPL24P83731 157 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 SLC23A3Q6PIS1 610 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 OR2C3Q8N628 320 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 ZBTB44Q8NCP5 570 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 RASL10BQ96S79 203 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 GPA33Q99795 319 aa14.51□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 H7C1H1 209 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 FCMRO60667 390 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 B4GALNT1Q00973 533 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 DMRTC1Q5HYR2 192 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 DCAF10Q5QP82 559 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 NCOR1O75376 2440 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 EVX1P49640 407 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 PRSS42Q7Z5A4 293 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 CNTD2Q9H8S5 307 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 PARP14Q460N5 1801 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 TMEM189A5PLL7 270 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 CLDN34H7C241 214 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 TSPAN7P41732 249 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 PRSS54Q6PEW0 395 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 RAB24Q969Q5 203 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 PAXXQ9BUH6 204 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 RPS27P42677 84 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 CTSSP25774 331 aa14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 RPS20P60866 119 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 A0A0B4J2E0 115 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 A0A1B0GX12 115 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 ZNF56Q15929 161 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 MPV17LQ2QL34 196 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 PRR33A8MZF0 331 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 TEX30Q5JUR7 227 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 OR4C13Q8NGP0 309 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 KCNAB3O43448 404 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 FABP5Q01469 135 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 B4GALT3O60512 393 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 EGR1P18146 543 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 PDCD1Q15116 288 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 SYT11Q9BT88 431 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 CKS2P33552 79 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 B4E171 279 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 CLEC2LP0C7M8 214 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 DCTDP32321 178 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 OR13C6PQ8NH95 151 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 GPX1P07203 203 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 FAM157CP0CG43 387 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.49□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 MFAP4P55083 255 aa14.48□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.48□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.48□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.48□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.48□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 PRR19A6NJB7 356 aa14.48□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 VSTM2LQ96N03 204 aa14.48□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 PRDX2P32119 198 aa14.48□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 FMODQ06828 376 aa14.48□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.48□□□□□ -0.09
USP13-201ENST00000263966 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms