RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567201.5

GGA2-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 2, human

TSL 4

Gene GGA2, Length 576 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA2-209	ENST00000567201	CD34	P28906	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	BDH1	Q02338	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	SSX2	Q16385	188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	PP6455	Q8WZ26	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	NRBF2	Q96F24	287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	RITA1	Q96K30	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	CEP19	Q96LK0	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	DPM3	Q9P2X0	92 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201		R4GMQ9	66 aa		4.87	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	LEUTX	A8MZ59	168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201		F8VVB4	439 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201		F8VWA3	439 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	GNGT2	O14610	69 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	MGST3	O14880	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	RAMP3	O60896	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	FAM107A	O95990	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	CST1	P01037	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	TTR	P02766	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	CSN2	P05814	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	CCL3L1	P16619	93 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	MNDA	P41218	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	FUT6	P51993	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	DLX1	P56177	255 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	EDDM3B	P56851	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ESRRG	P62508	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ACTA2	P62736	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ACTG2	P63267	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ACTC1	P68032	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ACTA1	P68133	377 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	GINS1	Q14691	196 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ZNF146	Q15072	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	GID4	Q8IVV7	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	RFT1	Q96AA3	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	EME1	Q96AY2	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	TEAD3	Q99594	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	CHID1	Q9BWS9	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	CHST5	Q9GZS9	411 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	MED20	Q9H944	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	CLN6	Q9NWW5	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201		K7EIL1	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	HSPA12A	O43301	675 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	FGF16	O43320	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	SULT1C4	O75897	302 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	KDM4B	O94953	1096 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	IGLL1	P15814	213 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	PRKACB	P22694	351 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	BLCAP	P62952	87 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	COL10A1	Q03692	680 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	ZNF91	Q05481	1191 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	APOF	Q13790	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GGA2-209	ENST00000567201	CTF1	Q16619	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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