RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474246.1

SMARCE1-208, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMARCE1, Length 2,124 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-208ENST00000474246 OR10K2Q6IF99 312 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF740Q8NDX6 193 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 OR4K1Q8NGD4 311 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 HMGCLL1Q8TB92 370 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 CNIH3Q8TBE1 160 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 DDIT4LQ96D03 193 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 TEX37Q96LM6 180 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 FRG2BQ96QU4 278 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 A0A0A0MQY5 61 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 MLNRO43193 412 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 SP1P08047 785 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 CD59P13987 128 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 PVRP15151 417 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 GGT1P19440 569 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 GATA3P23771 443 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 PNKDQ8N490 385 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 TRIB3Q96RU7 358 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 ADOQ96SZ5 270 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 ZBP1Q9H171 429 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 RNF121Q9H920 327 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 LOXL2Q9Y4K0 774 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 WIPI2Q9Y4P8 454 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 WDR27A2RRH5 827 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 K7ENP7 123 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 SEMA4FO95754 770 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 MOSP00540 346 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 PMP2P02689 132 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 CELA2AP08217 269 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 CDK2P24941 298 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 DLX1P56177 255 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 S100A10P60903 97 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 GNG5P63218 68 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 ADAM8P78325 824 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 LEG1Q6P5S2 330 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC35E3Q7Z769 313 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 SPICQ8N5J4 248 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 PPCDCQ96CD2 204 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 ZNF681Q96N22 645 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 SPATA25Q9BR10 227 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 SH3BGRL3Q9H299 93 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 CWH43Q9H720 699 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 C15orf61A6NNL5 157 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 G3V2L1 256 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 CRLF1O75462 422 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 CLDN1O95832 211 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 RENP00797 406 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 ACP2P11117 423 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 AGTR1P30556 359 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 TAS2R20P59543 309 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 RPS14P62263 151 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 RPS25P62851 125 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 GAGE2BQ13066 116 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 GGTLC2Q14390 218 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 MEF2DQ14814 521 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 NRF1Q16656 503 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 GAGE2EQ4V326 116 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 FAM27D1Q5T7N8 215 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 FNDC7Q5VTL7 733 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 TMEM64Q6YI46 380 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 STPG3Q8N7X2 389 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 OR4K5Q8NGD3 323 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 OR52E2Q8NGJ4 325 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 OR51A2Q8NGJ7 313 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-208ENST00000474246 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms