RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464	BANF2	Q9H503	90 aa		9.45	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	PSMB11	A5LHX3	300 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC01548	A6NM66	108 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	CCRL2	O00421	344 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	MAS1	P04201	325 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	PF4V1	P10720	104 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	MGMT	P16455	207 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	CEL	P19835	753 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	CD33	P20138	364 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR176	Q14439	515 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	HES1	Q14469	280 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464		Q3ZCU0	254 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	AWAT2	Q6E213	333 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464		Q8N9W7	124 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	OR4K15	Q8NH41	348 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	OR1L1	Q8NH94	360 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	TFAP2C	Q92754	450 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	S100A13	Q99584	98 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	CKLF	Q9UBR5	152 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	PLXNB1	O43157	2135 aa		9.44	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	HBZ	P02008	142 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	CD37	P11049	281 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	CD1B	P29016	333 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	KRTAP10-11	P60412	298 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	RNLS	Q5VYX0	342 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	RAB12	Q6IQ22	244 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	STX19	Q8N4C7	294 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	MRAP	Q8TCY5	172 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	SGCD	Q92629	289 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	ETAA1	Q9NY74	926 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		9.43	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	MYL12B	O14950	172 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	PDCD6	O75340	191 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	PF4	P02776	101 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	GLA	P06280	429 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	CDK1	P06493	297 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	FUT3	P21217	361 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR12	P47775	334 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC35A2	P78381	396 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	GNMT	Q14749	295 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	MOB3B	Q86TA1	216 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	STPG2	Q8N412	459 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	NEK7	Q8TDX7	302 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	ABCG5	Q9H222	651 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		9.42	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	SERPINE3	A8MV23	424 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464		K7EIL1	84 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	SPINT2	O43291	252 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	CA11	O75493	328 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	VSIG8	P0DPA2	414 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	CHAT	P28329	748 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	THBS3	P49746	956 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	CFHR3	Q02985	330 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	IRF3	Q14653	427 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	C6orf183	Q5T699	404 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		9.41	□□□□□ -0.9
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		9.41	□□□□□ -0.9

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