RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ECHDC1-208	ENST00000436638	RSG1	Q9BU20	258 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARV1	Q9H2C2	271 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ECHDC1-208	ENST00000436638	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ECHDC1-208	ENST00000436638	GPR84	Q9NQS5	396 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ECHDC1-208	ENST00000436638	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ECHDC1-208	ENST00000436638	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ECHDC1-208	ENST00000436638	HHLA2	Q9UM44	414 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ECHDC1-208	ENST00000436638	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.57
ECHDC1-208	ENST00000436638	CHD6	Q8TD26	2715 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A087WXM4	84 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	C5orf63	A6NC05	138 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	C17orf100	A8MU93	164 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638		H3BSH0	61 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	RS1	O15537	224 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	PAGE4	O60829	102 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	DHRS3	O75911	302 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	CD2	P06729	351 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADRA2A	P08913	450 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	SERPINA2	P20848	420 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	SSTR5	P35346	364 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	MAP2K4	P45985	399 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	NPBWR2	P48146	333 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	LGALS4	P56470	323 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	PKIA	P61925	76 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	CDK5R1	Q15078	307 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR8G1	Q15617	311 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	MICB	Q29980	383 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	MST1L	Q2TV78	715 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF773	Q6PK81	442 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	PLET1	Q6UQ28	207 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	MOB3C	Q70IA8	216 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	GPR148	Q8TDV2	347 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	PIGC	Q92535	297 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	C10orf35	Q96D05	121 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	MICU1	Q9BPX6	476 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF649	Q9BS31	505 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	LIME1	Q9H400	295 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	RNF150	Q9ULK6	438 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	SSR3	Q9UNL2	185 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	DHDH	Q9UQ10	334 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1B0GTI1	187 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF785	A8K8V0	405 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	MPTX1	A8MV57	137 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638		H7C417	338 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638		M0QXV9	152 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	CTDSPL	O15194	276 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	SIVA1	O15304	175 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	NRAS	P01111	189 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	CD8A	P01732	235 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV1-46	P01743	117 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	ISG15	P05161	165 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	SERPINE2	P07093	398 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	IRF2	P14316	349 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	CEL	P19835	753 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	CA6	P23280	308 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	PSMB9	P28065	219 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	DDT	P30046	118 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	S100A11	P31949	105 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	PDLIM4	P50479	330 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	CD300C	Q08708	224 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRDX4	Q13162	271 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	BTN1A1	Q13410	526 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR8B8	Q15620	311 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	POU2AF1	Q16633	256 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATP6V1F	Q16864	119 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZFP69	Q49AA0	526 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	IDNK	Q5T6J7	187 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	SATL1	Q86VE3	508 aa		5.2	□□□□□ -1.58
ECHDC1-208	ENST00000436638	COMMD7	Q86VX2	200 aa		5.2	□□□□□ -1.58

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