RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TBX5	Q99593	518 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	LYST	Q99698	3801 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM107B	Q9H098	131 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		8.42	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PPE3	182 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	IL1A	P01583	271 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHG4	P01861	327 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CSN2	P05814	226 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	RAP2A	P10114	183 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	SOX6	P35712	828 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZSR3	168 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF152	Q8N8N0	203 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf35	Q96D05	121 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	KCTD7	Q96MP8	289 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CLN6	Q9NWW5	311 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	VSIG4	Q9Y279	399 aa		8.41	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNA6	P05013	189 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ATF1	P18846	271 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ZP1	P60852	638 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ISL1	P61371	349 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511		Q8N9W7	124 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	DCUN1D4	Q92564	292 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	SPSB1	Q96BD6	273 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	OPALIN	Q96PE5	141 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	S1PR3	Q99500	378 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	GNB4	Q9HAV0	340 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	KIF25	Q9UIL4	384 aa		8.4	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	METTL15	A6NJ78	407 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511		H0YJX3	145 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	MOS	P00540	346 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ANXA8	P13928	327 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKACG	P22612	351 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	IL3RA	P26951	378 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMB8	P28062	276 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	VEGFC	P49767	419 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	EBI3	Q14213	229 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	8.39	□□□□□ -1.07
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SKAP2-209	ENST00000497511	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	EME1	Q96AY2	570 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	FGGY	Q96C11	551 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	SPACA5	Q96QH8	159 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4C12	Q96R67	309 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		8.39	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	SORL1	Q92673	2214 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKY	O43930	277 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	KDM4B	O94953	1096 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM107A	O95990	144 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1D-12	P01611	117 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM225B	P0DP42	221 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	MYF6	P23409	242 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	HTR1F	P30939	366 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP6V1E1	P36543	226 aa		8.38	□□□□□ -1.07
SKAP2-209	ENST00000497511	CRISP1	P54107	249 aa		8.38	□□□□□ -1.07

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