RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV1D-33P01593 117 aa20.74■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV1-33P01594 117 aa20.74■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIPK1Q13546 671 aa20.74■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MPV17LQ2QL34 196 aa20.74■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATAD3CQ5T2N8 411 aa20.74■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR13C5Q8NGS8 318 aa20.74■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHPT1Q8WUD6 406 aa20.74■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARL11Q969Q4 196 aa20.74■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINE3A8MV23 424 aa20.73■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC22A6Q4U2R8 563 aa20.73■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEK7Q8TDX7 302 aa20.73■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GHSRQ92847 366 aa20.73■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC2DQ9UHP7 191 aa20.73■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCRL2O00421 344 aa20.72■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LALBAP00709 142 aa20.72■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTF2F2P13984 249 aa20.72■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MED21Q13503 144 aa20.72■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOB3BQ86TA1 216 aa20.72■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00482Q8N8I6 264 aa20.72■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR51D1Q8NGF3 324 aa20.72■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR52M1Q8NGK5 317 aa20.72■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC107Q8WV48 283 aa20.72■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CKLFQ9UBR5 152 aa20.72■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa20.71■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa20.71■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PP11 408 aa20.71■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C15orf65H3BRN8 121 aa20.71■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 REG1BP48304 166 aa20.71■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC35E3Q7Z769 313 aa20.71■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBALD1Q8TB05 177 aa20.71■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM80Q96HE8 168 aa20.71■□□□□ 0.91
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EBAG9O00559 213 aa20.7■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ORC5O43913 435 aa20.7■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPX5O75715 221 aa20.7■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHG2P01859 326 aa20.7■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EBI3Q14213 229 aa20.7■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR176Q14439 515 aa20.7■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q499Y3 187 aa20.7■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YIF1BQ5BJH7 314 aa20.7■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF497Q6ZNH5 498 aa20.7■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STX19Q8N4C7 294 aa20.7■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00311Q8N616 119 aa20.7■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYGBQ8WWM9 190 aa20.7■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GFOD1Q9NXC2 390 aa20.7■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00527Q9UJ94 153 aa20.7■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 K7EIL1 84 aa20.69■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MT-ND4P03905 459 aa20.69■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC35B1P78383 322 aa20.69■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC23Q5W5X9 447 aa20.69■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ETV3LQ6ZN32 361 aa20.69■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2W3Q7Z3T1 314 aa20.69■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXRED2Q8IWF2 684 aa20.69■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFP41Q8N8Y5 198 aa20.69■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C8orf31Q8N9H6 132 aa20.69■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPACA1Q9HBV2 294 aa20.69■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFP57Q9NU63 452 aa20.69■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa20.68■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa20.68■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEA13PA6NCF6 341 aa20.68■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AIPO00170 330 aa20.68■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL3RAP26951 378 aa20.68■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IZUMO1Q8IYV9 350 aa20.68■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COMMD1Q8N668 190 aa20.68■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SETD9Q8NE22 299 aa20.68■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR61Q9BZJ8 451 aa20.68■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUDT19A8MXV4 375 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV3-43DP0DP04 118 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FSTP19883 344 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THBS3P49746 956 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP10-11P60412 298 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC36Q1X8D7 754 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 JAGN1Q8N5M9 183 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2T10Q8NGZ9 312 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUL1Q969V5 352 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGLYRP3Q96LB9 341 aa20.67■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCRIP1C9JLW8 97 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC6A1P30531 599 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C8orf86Q6ZUL3 223 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STPG2Q8N412 459 aa20.66■□□□□ 0.9
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q8N6K4 173 aa20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms