RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
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HOXD8-202ENST00000429017 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
HOXD8-202ENST00000429017 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa5.15□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 LEUTXA8MZ59 168 aa5.15□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa5.15□□□□□ -1.59
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HOXD8-202ENST00000429017 FADS2O95864 444 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
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HOXD8-202ENST00000429017 BRS3P32247 399 aa5.15□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 OR3A4PP47883 348 aa5.15□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 POU3F4P49335 361 aa5.15□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 ST3GAL4Q11206 333 aa5.15□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5.15□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 Q6P435 159 aa5.15□□□□□ -1.59
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HOXD8-202ENST00000429017 C5orf56Q8N8D9 126 aa5.15□□□□□ -1.59
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HOXD8-202ENST00000429017 BORCS8Q96FH0 119 aa5.15□□□□□ -1.59
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HOXD8-202ENST00000429017 PRR25Q96S07 402 aa5.15□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 ASCL2Q99929 193 aa5.15□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
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HOXD8-202ENST00000429017 ACOT13Q9NPJ3 140 aa5.15□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 TAS2R3Q9NYW6 316 aa5.15□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 AASSQ9UDR5 926 aa5.15□□□□□ -1.59
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HOXD8-202ENST00000429017 U3KQK5 164 aa5.15□□□□□ -1.59
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HOXD8-202ENST00000429017 LUMP51884 338 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
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HOXD8-202ENST00000429017 SLC22A1O15245 554 aa5.13□□□□□ -1.59
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HOXD8-202ENST00000429017 KRT8P05787 483 aa5.13□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 CALRP27797 417 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 MAP2K4P45985 399 aa5.13□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 SERPINB10P48595 397 aa5.13□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 RBP2P50120 134 aa5.13□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 ATP1B3P54709 279 aa5.13□□□□□ -1.59
HOXD8-202ENST00000429017 MTCP1P56278 107 aa5.13□□□□□ -1.59
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