RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 TMEM116Q8NCL8 245 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 STXBP6Q8NFX7 210 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 IL22RA2Q969J5 263 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 MSL2Q9HCI7 577 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 TNFRSF19Q9NS68 423 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 NKX2-6A6NCS4 301 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 B4E171 279 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 ZNF253O75346 499 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 IGHV4-34P06331 123 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 TSPAN7P41732 249 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 SSX8Q7RTT4 187 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 LYZL2Q7Z4W2 148 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 MDP1Q86V88 176 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 MIOXQ9UGB7 285 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 ADAM11O75078 769 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 COL8A1P27658 744 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 SLC35E3Q7Z769 313 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 OR1L8Q8NGR8 309 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 ISOC2Q96AB3 205 aa16.18■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 B4DEV8 164 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 OR4X1Q8NH49 305 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 CSN3P07498 182 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 NPY1RP25929 384 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 RPL29P47914 159 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 TCL1AP56279 114 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 VWA1Q6PCB0 445 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 PGLYRP3Q96LB9 341 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 SEMA7AO75326 666 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 B2MP61769 119 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 FDX2Q6P4F2 183 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 HOGA1Q86XE5 327 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 ZNF441Q8N8Z8 693 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 KCNMB2Q9Y691 235 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 TRAV39A0A0B4J263 110 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 MFNGO00587 321 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 PTP4A3O75365 173 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 ARG1P05089 322 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 G6PCP35575 357 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 HIST3H3Q16695 136 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 PTX4Q96A99 478 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 TTTY12Q9BZ98 90 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 LPAR5Q9H1C0 372 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 ASCL3Q9NQ33 180 aa16.17■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 TRAV34A0A0B4J273 112 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 RIGQ13278 110 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 GABRA6Q16445 453 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 PLPPR5Q32ZL2 321 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 C10orf113Q5VZT2 155 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 FAM157CP0CG43 387 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 RPL7P18124 248 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 GZMMP51124 257 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 ZP4Q12836 540 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 LYRM7Q5U5X0 104 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 GPA33Q99795 319 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 NGFRP08138 427 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 FAM27BQ5VT28 67 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 MRGPRGQ86SM5 289 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 TMEM191AQ9H0A3 160 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 COL18A1P39060 1754 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 PCM1Q15154 2024 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 M0R2Z0 102 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 C1orf174Q8IYL3 243 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 CHAC2Q8WUX2 184 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 DCAF16Q9NXF7 216 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 VSIG4Q9Y279 399 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 BCORQ6W2J9 1755 aa16.16■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 AESQ08117 197 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 OR2J1Q9GZK6 312 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 A0A087X0M5 115 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 A0A1B0GX30 115 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 GGTLC2Q14390 218 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 ELOBQ15370 118 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 FAM74A3Q4VXF1 159 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 TEPPQ6URK8 271 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 LRRC3BQ96PB8 259 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 A0A0J9YW62 118 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 ERVH48-1M5A8F1 160 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 PDE6DO43924 150 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 DHRS11Q6UWP2 260 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 TTRP02766 147 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 PGA4P0DJD7 388 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 PGA5P0DJD9 388 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 DAOP14920 347 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 CD40P25942 277 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 IFITM2Q01629 132 aa16.15■□□□□ 0.18
USP25-204ENST00000400183 LRP11Q86VZ4 500 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms