RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602498.1

HCG18-243, Transcript of HLA complex group 18, human

TSL 3 BASIC

Gene HCG18, Length 327 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCG18-243	ENST00000602498	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	MMP28	Q9H239	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498		J3QR06	171 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	MYL12B	O14950	172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	PIN1P1	O15428	100 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	SLC31A2	O15432	143 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	OGG1	O15527	345 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	IL1A	P01583	271 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	RBP4	P02753	201 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	HSMCR30	P0CW71	290 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	BDH1	Q02338	343 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	AANAT	Q16613	207 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498		Q499Y3	187 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	CCDC58	Q4VC31	144 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	SETD9	Q8NE22	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	PXT1	Q8NFP0	134 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	CORO2A	Q92828	525 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	RDH12	Q96NR8	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	CKLF	Q9UBR5	152 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HCG18-243	ENST00000602498	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	AIP	O00170	330 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	ALX3	O95076	343 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	MPIG6B	O95866	241 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	IGLV1-47	P01700	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	AMY1A	P04745	511 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	AMY2A	P04746	511 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	BRS3	P32247	399 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	MNDA	P41218	407 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	MAP2K4	P45985	399 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	PRRX1	P54821	245 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	AQP4	P55087	323 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	WNT4	P56705	351 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	MED21	Q13503	144 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	P2RY14	Q15391	338 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	ELP2	Q6IA86	826 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	OR52W1	Q6IF63	320 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.52	□□□□□ -1.69
HCG18-243	ENST00000602498	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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