RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 TP53RKQ96S44 253 aa14.18□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 DMRTA2Q96SC8 542 aa14.18□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.18□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.18□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 ACACAQ13085 2346 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 TRAV39A0A0B4J263 110 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 A6NLC8 198 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 I3L521 148 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 SH2D1BO14796 132 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 TUSC2O75896 110 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 HLA-DRB3P79483 266 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 Q6ZR03 302 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 PDZD9Q8IXQ8 264 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 LGI3Q8N145 548 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 LRTM2Q8N967 370 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 FAM57AQ8TBR7 257 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 OR14J1Q9UGF5 321 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 SCGB1D2O95969 90 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 MDH2P40926 338 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 NAAAQ02083 359 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 ZNF146Q15072 292 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 AANATQ16613 207 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 FAM185AQ8N0U4 392 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 GAPTQ8N292 157 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 FAM169BQ8N8A8 192 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 C18orf12Q96KH6 178 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 TUBD1Q9UJT1 453 aa14.17□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 M0R1B8 84 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 KCNJ3P48549 501 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 PCSK4Q6UW60 755 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 KIRREL1Q96J84 757 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 PCDHB10Q9UN67 800 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 GPR31O00270 319 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 HSD17B6O14756 317 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 WNT9BO14905 357 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 ZNF497Q6ZNH5 498 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 C11orf53Q8IXP5 236 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 AQP10Q96PS8 301 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 GPHA2Q96T91 129 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 UFSP2Q9NUQ7 469 aa14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 TEX46H3BTG2 121 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 P2RX3P56373 397 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 SMCO1Q147U7 214 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 SMUG1Q53HV7 270 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 PRR18Q8N4B5 295 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 SLC25A32Q9H2D1 315 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 SDHAF2Q9NX18 166 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 TREM2Q9NZC2 230 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 H7C1Q1 480 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 HAND1O96004 215 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 MUCL1Q96DR8 90 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 HES4Q9HCC6 221 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 PFDN2Q9UHV9 154 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
TOM1-216ENST00000492723 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
TOM1-216ENST00000492723 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.14□□□□□ -0.15
TOM1-216ENST00000492723 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.14□□□□□ -0.15
TOM1-216ENST00000492723 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
TOM1-216ENST00000492723 SLC35G3Q8N808 338 aa14.14□□□□□ -0.15
TOM1-216ENST00000492723 DUSP13Q9UII6 198 aa14.14□□□□□ -0.15
TOM1-216ENST00000492723 DEDDO75618 318 aa14.14□□□□□ -0.15
TOM1-216ENST00000492723 BMP5P22003 454 aa14.14□□□□□ -0.15
TOM1-216ENST00000492723 RND3P61587 244 aa14.14□□□□□ -0.15
TOM1-216ENST00000492723 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
TOM1-216ENST00000492723 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
TOM1-216ENST00000492723 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms