RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479153.1

SUMO3-206, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, human

TSL 2

Gene SUMO3, Length 1,736 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO3-206	ENST00000479153	CCL3L1	P16619	93 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	GLP1R	P43220	463 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	ERVFRD-1	P60508	538 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	ARF6	P62330	175 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	TCF23	Q7RTU1	214 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	TMEM186	Q96B77	213 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	CMTM3	Q96MX0	182 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	FUOM	A2VDF0	154 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	XRCC3	O43542	346 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	MT-ND4	P03905	459 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	TAS2R20	P59543	309 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	ARFRP1	Q13795	201 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	CNIH2	Q6PI25	160 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	UBALD1	Q8TB05	177 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	SETD6	Q8TBK2	473 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	MMP27	Q9H306	513 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153		A0A0A6YYH2	397 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	hADV38S2	A0JD32	116 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153		A6NJ64	397 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	LIPF	P07098	398 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	CD3G	P09693	182 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	DLX1	P56177	255 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153		Q6ZPA2	131 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	TNFSF8	P32971	234 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	MNDA	P41218	407 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153		A0A0G2JMP0	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153		A0A0X1KG70	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	SERPINE3	A8MV23	424 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	LY6G6D	O95868	133 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	NAPSA	O96009	420 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	HLA-DQB1	P01920	261 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	FCER2	P06734	321 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	OMG	P23515	440 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	S100A5	P33763	92 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	SSTR5	P35346	364 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	TALDO1	P37837	337 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	GNG2	P59768	71 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	PAX5	Q02548	391 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	GUCA2A	Q02747	115 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	HACD4	Q5VWC8	232 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	GAPT	Q8N292	157 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	PRR18	Q8N4B5	295 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	RFESD	Q8TAC1	157 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	ZNF714	Q96N38	554 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	CD5L	O43866	347 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SUMO3-206	ENST00000479153	CA11	O75493	328 aa		10.78	□□□□□ -0.68

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