RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 KCNJ3P48549 501 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 PCSK4Q6UW60 755 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 OR8H3Q8N146 312 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 OR4A4PQ8NGN8 299 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SYT3Q9BQG1 590 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 OR14J1Q9UGF5 321 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 MAB21L2Q9Y586 359 aa14.55□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A0D9SG52 128 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 H7C1Q1 480 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 GNRHRP30968 328 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 MZT1Q08AG7 82 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 IL15RAQ13261 267 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF345Q14585 488 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SP6Q3SY56 376 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 RNF126Q9BV68 326 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 JKAMPQ9P055 326 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 RNF222A6NCQ9 220 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 OR2F2O95006 317 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 CD200P41217 278 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 OR2F1Q13607 317 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 CABLES2Q9BTV7 478 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 PCDHB10Q9UN67 800 aa14.54□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 H0YIZ8 118 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 C16orf97H3BN30 126 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 LMO1P25800 156 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 VHLLQ6RSH7 139 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SECTM1Q8WVN6 248 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 IGF2RP11717 2491 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 TRAV39A0A0B4J263 110 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 PSPNO60542 156 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 CD40P25942 277 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 RBPJQ06330 500 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 GGNBP1Q5YKI7 109 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM185AQ8N0U4 392 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 LRTM2Q8N967 370 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 KIRREL1Q96J84 757 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 GLS2Q9UI32 602 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 TUBD1Q9UJT1 453 aa14.53□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 MPPED1O15442 326 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 LIAT1Q6ZQX7 453 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 GSKIPQ9P0R6 139 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TAAR3PQ9P1P4 343 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 WIPI2Q9Y4P8 454 aa14.52□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 GPR31O00270 319 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 LYL1P12980 280 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 RND3P61587 244 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 BEX5Q5H9J7 111 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC51BQ86UW2 128 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 PRR7Q8TB68 274 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 LRRC29Q8WV35 223 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 B3GALNT1O75752 331 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 IFNA21P01568 189 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 RAB32Q13637 225 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CLLU1Q5K131 121 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 PRSS54Q6PEW0 395 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 DCUN1D4Q92564 292 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 C18orf12Q96KH6 178 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TP53RKQ96S44 253 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CCL28Q9NRJ3 127 aa14.51□□□□□ -0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 MEMO1Q9Y316 297 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 343.7 ms