RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561524.5

KIFC3-208, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-208	ENST00000561524	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		13.39	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		13.39	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	NOTCH1	P46531	2555 aa		13.39	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	OOSP1	A8MZH6	123 aa		13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	PLXNB1	O43157	2135 aa		13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	CLIC3	O95833	236 aa		13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	PPP3R1	P63098	170 aa		13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	RSU1	Q15404	277 aa		13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	TMEM219	Q86XT9	240 aa		13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	CYGB	Q8WWM9	190 aa		13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	TOR1A	O14656	332 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	BDKRB2	P30411	391 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	LINC00596	Q86U02	117 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	METTL9	Q9H1A3	318 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	LY6L	H3BQJ8	138 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	LALBA	P00709	142 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	GDNF	P39905	211 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524		Q499Y3	187 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	OR9G1	Q8NH87	305 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	GGH	Q92820	318 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	GHSR	Q92847	366 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	KIRREL1	Q96J84	757 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		13.36	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	FBXO24	O75426	580 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	HTR3B	O95264	441 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	OPN1MW	P04001	364 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	CD1A	P06126	327 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	TAS2R43	P59537	309 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	BLCAP	P62952	87 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	ST3GAL4	Q11206	333 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	RIPK1	Q13546	671 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	GPR176	Q14439	515 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	RCN1	Q15293	331 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	MPV17L	Q2QL34	196 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	DDI2	Q5TDH0	399 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	CDH26	Q8IXH8	852 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	OSR2	Q8N2R0	312 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	S100A13	Q99584	98 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	CALY	Q9NYX4	217 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	CKLF	Q9UBR5	152 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	KIF25	Q9UIL4	384 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	ING4	Q9UNL4	249 aa		13.35	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	IL1A	P01583	271 aa		13.34	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	FST	P19883	344 aa		13.34	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	GZMH	P20718	246 aa		13.34	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	CAPG	P40121	348 aa		13.34	□□□□□ -0.27
KIFC3-208	ENST00000561524	MNDA	P41218	407 aa		13.34	□□□□□ -0.27

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