RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516658.1

RNU6-347P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 347, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-347P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAM228BP0C875 321 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 SULT1A3P0DMM9 295 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 SULT1A4P0DMN0 295 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 OR12D1P0DN82 309 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 IDO1P14902 403 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 CXCL3P19876 107 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 CD34P28906 385 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 MARCKSL1P49006 195 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 C1QTNF8P60827 252 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 HPCAP84074 193 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 CENPWQ5EE01 88 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAAP20Q6NZ36 180 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNAJC24Q6P3W2 148 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF773Q6PK81 442 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 RFLNAQ6ZTI6 216 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF439Q8NDP4 499 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 SPPL2BQ8TCT7 592 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 ABHD3Q8WU67 409 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 MAFIPQ8WZ33 124 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 OR4K3Q96R72 315 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 PLEKHF1Q96S99 279 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 INIPQ9NRY2 104 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 SMPXQ9UHP9 88 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 VPREB3Q9UKI3 123 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-347P-201ENST00000516658 SYNMO15061 1565 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 A0A087X002 238 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 EVPLLA8MZ36 301 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 C9JQL5 133 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 KCNK2O95069 426 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 CA2P00918 260 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 CXCL2P19875 107 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZBTB25P24278 435 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 S100GP29377 79 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 EIF1P41567 113 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 NUDT2P50583 147 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 CRYBA4P53673 196 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 SNAP25P60880 206 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 SSX1Q16384 188 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF404Q494X3 552 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMEM215Q68D42 235 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 LINC00596Q86U02 117 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 SLC25A45Q8N413 288 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 STX19Q8N4C7 294 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 UBL4BQ8N7F7 174 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 C7orf33Q8WU49 177 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 DCUN1D4Q92564 292 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 GHSRQ92847 366 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 BORCS5Q969J3 196 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 YIPF5Q969M3 257 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 PTX4Q96A99 478 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 OR7D2Q96RA2 312 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 LINC01587Q99440 93 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 GPER1Q99527 375 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 MED18Q9BUE0 208 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 PSG8Q9UQ74 426 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 NDUFAF1Q9Y375 327 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 FIS1Q9Y3D6 152 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 HSPB11Q9Y547 144 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 WDR62O43379 1518 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 CCDC144AA2RUR9 1427 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 OR11H12B2RN74 326 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 F5H5P2 479 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 PDE6DO43924 150 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 SERPINB7O75635 380 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 S1PR2O95136 353 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 SOD3P08294 240 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 SCGB1A1P11684 91 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 GABRA4P48169 554 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 UBE2AP49459 152 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 GNG3P63215 75 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 KIAA0040Q15053 153 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMEM183BQ1AE95 376 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 TEX36Q5VZQ5 186 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF774Q6NX45 483 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 OOSP2Q86WS3 158 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 C20orf196Q8IYI0 205 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 DRAM1Q8N682 238 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 OR11H1Q8NG94 326 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 OR11H2Q8NH07 326 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-347P-201ENST00000516658 RHOXF1Q8NHV9 184 aa3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.9 ms