RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SCOC	Q9UIL1	159 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511		V9GYS6	101 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		8.49	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	AP4M1	O00189	453 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINA3	P01011	423 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	OCM2	P0CE71	109 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	CD34	P28906	385 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	OR3A1	P47881	315 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC42	P60953	191 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SCN1B	Q07699	218 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	AES	Q08117	197 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR50	Q13585	617 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2T29	Q8NH02	315 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	OR9G1	Q8NH87	305 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	GIPC3	Q8TF64	312 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	RNFT2	Q96EX2	444 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	FEV	Q99581	238 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ADI1	Q9BV57	179 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	IFT22	Q9H7X7	185 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511		R4GMQ9	66 aa		8.48	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SH2D1B	O14796	132 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SYT7	O43581	403 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	JTB	O76095	146 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1D-33	P01593	117 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1-33	P01594	117 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHG2	P01859	326 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF44	P15621	663 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	BCL3	P20749	454 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	PRDX6	P30041	224 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	GLIPR1	P48060	266 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	INSL3	P51460	131 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP1B3	P54709	279 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	APOL4	Q9BPW4	351 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	COPS3	Q9UNS2	423 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		8.47	□□□□□ -1.05
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GTI1	187 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ODAM	A1E959	279 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR32	B1ATL7	298 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	LY6L	H3BQJ8	138 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ENTPD6	O75354	484 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-7	P01780	117 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ELANE	P08246	267 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	VDAC1	P21796	283 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEA2	P43356	314 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	NPBWR2	P48146	333 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	RBP2	P50120	134 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB7A	P51149	207 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCR4	P61073	352 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXE3	Q13461	319 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	MADCAM1	Q13477	382 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF146	Q15072	292 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2V2	Q15819	145 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	LTC4S	Q16873	150 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	OR11H1	Q8NG94	326 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	GPHA2	Q96T91	129 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT84	Q9NSB2	600 aa		8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	8.46	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01548	A6NM66	108 aa		8.45	□□□□□ -1.06
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	8.45	□□□□□ -1.06

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