RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
TOM1-216ENST00000492723 RHOFQ9HBH0 211 aa14.22□□□□□ -0.13
TOM1-216ENST00000492723 OR5AC2Q9NZP5 309 aa14.22□□□□□ -0.13
TOM1-216ENST00000492723 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
TOM1-216ENST00000492723 MEMO1Q9Y316 297 aa14.22□□□□□ -0.13
TOM1-216ENST00000492723 ATP23Q9Y6H3 246 aa14.22□□□□□ -0.13
TOM1-216ENST00000492723 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.22□□□□□ -0.13
TOM1-216ENST00000492723 NXPH2O95156 264 aa14.22□□□□□ -0.13
TOM1-216ENST00000492723 DIRAS3O95661 229 aa14.22□□□□□ -0.13
TOM1-216ENST00000492723 IFNA21P01568 189 aa14.22□□□□□ -0.13
TOM1-216ENST00000492723 IGLV1-44P01699 117 aa14.22□□□□□ -0.13
TOM1-216ENST00000492723 HERPUD1Q15011 391 aa14.22□□□□□ -0.13
TOM1-216ENST00000492723 Q8IYB0 196 aa14.22□□□□□ -0.13
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TOM1-216ENST00000492723 RASL12Q9NYN1 266 aa14.22□□□□□ -0.13
TOM1-216ENST00000492723 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
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TOM1-216ENST00000492723 PRSS54Q6PEW0 395 aa14.21□□□□□ -0.13
TOM1-216ENST00000492723 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.21□□□□□ -0.13
TOM1-216ENST00000492723 OR8G5Q8NG78 346 aa14.21□□□□□ -0.13
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TOM1-216ENST00000492723 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa14.21□□□□□ -0.14
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TOM1-216ENST00000492723 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.21□□□□□ -0.14
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TOM1-216ENST00000492723 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.21□□□□□ -0.14
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TOM1-216ENST00000492723 GLAP06280 429 aa14.2□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 IL15RAQ13261 267 aa14.2□□□□□ -0.14
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TOM1-216ENST00000492723 ARID1AO14497 2285 aa14.2□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa14.2□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
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TOM1-216ENST00000492723 SLC25A15Q9Y619 301 aa14.2□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 OR2H2O95918 312 aa14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 GCH1P30793 250 aa14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 GNRHRP30968 328 aa14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 SPIN3Q5JUX0 258 aa14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 LIAT1Q6ZQX7 453 aa14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 ZNF565Q8N9K5 539 aa14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 ATMQ13315 3056 aa14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 CTXN2P0C2S0 81 aa14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 LYL1P12980 280 aa14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 KRTCAP3Q53RY4 240 aa14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 OR1S1Q8NH92 325 aa14.19□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 S100PBPQ96BU1 408 aa14.19□□□□□ -0.14
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TOM1-216ENST00000492723 TUBG1P23258 451 aa14.18□□□□□ -0.14
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TOM1-216ENST00000492723 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
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TOM1-216ENST00000492723 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.18□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa14.18□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa14.18□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 MPPED1O15442 326 aa14.18□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 IGKV1-13P0DP09 117 aa14.18□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 KITLGP21583 273 aa14.18□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 TIMP3P35625 211 aa14.18□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 TOR2AQ5JU69 321 aa14.18□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 FAM74A1Q5RGS3 127 aa14.18□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14.18□□□□□ -0.14
TOM1-216ENST00000492723 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
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