RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407417.7

NFIA-208, Transcript of nuclear factor I A, human

TSL 2 BASIC

Gene NFIA, Length 2,123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIA-208	ENST00000407417	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF43	P17038	809 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	HOXC12	P31275	282 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ALDH3B1	P43353	468 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	FHIT	P49789	147 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	EFNA3	P52797	238 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	MTCP1	P56278	107 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	VAMP2	P63027	116 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	QRFP	P83859	136 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	IL24	Q13007	206 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	FAM53B	Q14153	422 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	MORN2	Q502X0	79 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	C4orf17	Q53FE4	359 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	LRTM2	Q8N967	370 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	OTOS	Q8NHW6	89 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ERGIC1	Q969X5	290 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	C8orf44	Q96CB5	159 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	TP53RK	Q96S44	253 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	AICDA	Q9GZX7	198 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	KCNK15	Q9H427	330 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	HHLA2	Q9UM44	414 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	WIPF3	A6NGB9	483 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF732	B4DXR9	585 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	NGFR	P08138	427 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CHRNB4	P30926	498 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	PAFAH1B2	P68402	229 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	LCN2	P80188	198 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ARL6IP1	Q15041	203 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	NT5C	Q8TCD5	201 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417		Q9N2K0	584 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	DECR2	Q9NUI1	292 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SCN2A	Q99250	2005 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417		A0A0G2JN53	185 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CYR61	O00622	381 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	FBXO45	P0C2W1	286 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	KLK2	P20151	261 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	EMP2	P54851	167 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ARF6	P62330	175 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	PCK2	Q16822	640 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	DEFB134	Q4QY38	66 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	RTL6	Q6ICC9	239 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	GPR119	Q8TDV5	335 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	GRHL3	Q8TE85	626 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	TSLP	Q969D9	159 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	WFDC1	Q9HC57	220 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	AK3	Q9UIJ7	227 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417		H0YIG0	161 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	PITX3	O75364	302 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SELE	P16581	610 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	PTN	P21246	168 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	GRPR	P30550	384 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	DNASE1L1	P49184	302 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	UBE2G2	P60604	165 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	CHST4	Q8NCG5	386 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NFIA-208	ENST00000407417	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		7.36	□□□□□ -1.23

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